RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 HEY1Q9Y5J3 304 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 RFX8Q6ZV50 586 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF534Q76KX8 674 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 P2RY11Q96G91 374 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 C20orf27Q9GZN8 174 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGAP42A6NI28 874 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 UQCRBP14927 111 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 GSTT1P30711 240 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 FDFT1P37268 417 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC14Q49A88 953 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 BTBD9Q96Q07 612 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 DEUP1Q05D60 604 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 BIRC2Q13490 618 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 MSANTD2Q6P1R3 559 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC26A9Q7LBE3 791 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 TAC4Q86UU9 113 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 GORASP1Q9BQQ3 440 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 EBF4Q9BQW3 602 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 WNT16Q9UBV4 365 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-201ENST00000246533 UGT1A9O60656 530 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 PLIN3O60664 434 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 GSRP00390 522 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 SDC4P31431 198 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 FSCBQ5H9T9 825 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC2A13Q96QE2 648 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 EPB41L1Q9H4G0 881 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 UGT1A7Q9HAW7 530 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 UGT1A10Q9HAW8 530 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 UGT1A8Q9HAW9 530 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM221A6NGB7 291 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 HACD1B0YJ81 288 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 M0R296 226 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 SIN3BO75182 1162 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 RUNX3Q13761 415 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 SYCP2LQ5T4T6 812 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa26.51■■□□□ 1.83
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CAPNS1-201ENST00000246533 TXNDC11Q6PKC3 985 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 HTR3DQ70Z44 454 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa26.5■■□□□ 1.83
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CAPNS1-201ENST00000246533 E2F8A0AVK6 867 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 AP1G1O43747 822 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 COG7P83436 770 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 NIPAL4Q0D2K0 466 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 CNPY1Q3B7I2 92 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 FAXCQ5TGI0 409 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 DENND1CQ8IV53 801 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 HAPLN3Q96S86 360 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 COX16Q9P0S2 106 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 PDLIM1O00151 329 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 HARS2P49590 506 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 PDE1BQ01064 536 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB6CQ53S08 254 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 METTL21CQ5VZV1 264 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 Q6ZNB5 142 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB6CQ9H0N0 254 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 PIAS3Q9Y6X2 628 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 ZCCHC18P0CG32 403 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 MX2P20592 715 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS6KA3P51812 740 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 PFKPQ01813 784 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 DPYSL2Q16555 572 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC153Q494R4 210 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 SCYL2Q6P3W7 929 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 TPRG1Q6ZUI0 275 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 RAPH1Q70E73 1250 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM126BQ8IUX1 230 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 DNASE1L2Q92874 299 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 TRPV5Q9NQA5 729 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 ATG2BQ96BY7 2078 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-201ENST00000246533 METTL18O95568 372 aa26.48■■□□□ 1.83
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