RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa20.28■□□□□ 0.84
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CTDP1-208ENST00000613122 KCTD4Q8WVF5 259 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 LCLAT1Q6UWP7 414 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 ZFP14Q9HCL3 533 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 KCNK4Q9NYG8 393 aa20.28■□□□□ 0.84
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CTDP1-208ENST00000613122 KRT75O95678 551 aa20.28■□□□□ 0.84
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CTDP1-208ENST00000613122 ICAM3P32942 547 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 FLT3P36888 993 aa20.28■□□□□ 0.84
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CTDP1-208ENST00000613122 GPR135Q8IZ08 494 aa20.28■□□□□ 0.84
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CTDP1-208ENST00000613122 OR52L1Q8NGH7 329 aa20.28■□□□□ 0.84
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CTDP1-208ENST00000613122 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 SLC25A12O75746 678 aa20.27■□□□□ 0.84
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CTDP1-208ENST00000613122 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa20.27■□□□□ 0.84
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CTDP1-208ENST00000613122 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa20.27■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 E7ENQ6 273 aa20.27■□□□□ 0.84
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CTDP1-208ENST00000613122 MDM4O15151 490 aa20.27■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 CA12O43570 354 aa20.27■□□□□ 0.84
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CTDP1-208ENST00000613122 GRIA4P48058 902 aa20.27■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa20.27■□□□□ 0.84
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CTDP1-208ENST00000613122 CD101Q93033 1021 aa20.27■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 PCDH18Q9HCL0 1135 aa20.27■□□□□ 0.84
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CTDP1-208ENST00000613122 CDYL2Q8N8U2 506 aa20.27■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 C19orf18Q8NEA5 215 aa20.27■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 OR6Y1Q8NGX8 325 aa20.27■□□□□ 0.84
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CTDP1-208ENST00000613122 B3GNT5Q9BYG0 378 aa20.27■□□□□ 0.84
CTDP1-208ENST00000613122 LRRC19Q9H756 370 aa20.27■□□□□ 0.84
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CTDP1-208ENST00000613122 ARSHQ5FYA8 562 aa20.27■□□□□ 0.83
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CTDP1-208ENST00000613122 MCRS1Q96EZ8 462 aa20.27■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 VPS4AQ9UN37 437 aa20.27■□□□□ 0.83
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CTDP1-208ENST00000613122 CTBP1Q13363 440 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 ZFP1Q6P2D0 407 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF276Q8N554 614 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 GLOD4Q9HC38 313 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 CHKBQ9Y259 395 aa20.26■□□□□ 0.83
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CTDP1-208ENST00000613122 TRIM24O15164 1050 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 UGT2B4P06133 528 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 CXCR3P49682 368 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 C9orf16Q9BUW7 83 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 FBXO5Q9UKT4 447 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 CILPO75339 1184 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 ZCCHC18P0CG32 403 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 CLOCKO15516 846 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
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CTDP1-208ENST00000613122 OR14C36Q8NHC7 312 aa20.26■□□□□ 0.83
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CTDP1-208ENST00000613122 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
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CTDP1-208ENST00000613122 HK2P52789 917 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF549Q6P9A3 640 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 OR52K2Q8NGK3 314 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 FBXO30Q8TB52 745 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 ING5Q8WYH8 240 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 C19orf60Q96EN9 201 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 P2RY11Q96G91 374 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 A0A1W2PQ67 120 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 HGFP14210 728 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 TAS2R40P59535 323 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 ADHFE1Q8IWW8 467 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDP1-208ENST00000613122 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
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