RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 CACHD1Q5VU97 1274 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FAM171BQ6P995 826 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 NSMFQ6X4W1 530 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SLC30A10Q6XR72 485 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TPGS1Q6ZTW0 290 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 OVCH2Q7RTZ1 564 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF554Q86TJ5 538 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FJX1Q86VR8 437 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 METTL23Q86XA0 190 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF677Q86XU0 584 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 C2CD5Q86YS7 1000 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CAMK1DQ8IU85 385 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CPOQ8IVL8 374 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 RHOT2Q8IXI1 618 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 KIAA2013Q8IYS2 634 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TAGAPQ8N103 731 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 KRT78Q8N1N4 520 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PLD5Q8N7P1 536 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FAM133AQ8N9E0 248 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ATG16L2Q8NAA4 619 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CNNM3Q8NE01 707 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC112Q8NEF3 446 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 MCPH1Q8NEM0 835 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TTLQ8NG68 377 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 OR2W6PQ8NHA6 318 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF461Q8TAF7 563 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 METTL6Q8TCB7 284 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CHTF18Q8WVB6 975 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF566Q969W8 418 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CYFIP2Q96F07 1278 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ANKRD27Q96NW4 1050 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 USP28Q96RU2 1077 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TESK2Q96S53 571 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 GPHA2Q96T91 129 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PLIN2Q99541 437 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 RAD9AQ99638 391 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CDC6Q99741 560 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FAM118BQ9BPY3 351 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 STRA6Q9BX79 667 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 GPR61Q9BZJ8 451 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 DCLK3Q9C098 648 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 KLHL4Q9C0H6 718 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 NUP62CLQ9H1M0 184 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 GBA3Q9H227 469 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TPK1Q9H3S4 243 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 LZTFL1Q9NQ48 299 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 DECR2Q9NUI1 292 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 THAP1Q9NVV9 213 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ASNSD1Q9NWL6 643 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 NDUFA13Q9P0J0 144 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 VPS54Q9P1Q0 977 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM10Q9UDY6 481 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ATP6V1HQ9UI12 483 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SERPINB13Q9UIV8 391 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CLCA2Q9UQC9 943 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CLDN16Q9Y5I7 305 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FADS3Q9Y5Q0 445 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 USP16Q9Y5T5 823 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FHAD1B1AJZ9 1412 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 NPATQ14207 1427 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ERICH3Q5RHP9 1530 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 NACADO15069 1562 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 A0A0A6YYJ9 748 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PRV1 198 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 UBE2QL1A1L167 161 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 A4D1N5 150 aa3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms