RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511276.1

FAM53C-208, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, human

TSL 4

Gene FAM53C, Length 571 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53C-208	ENST00000511276	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	RTP4	Q96DX8	246 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	ITPR3	Q14573	2671 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	WIPF3	A6NGB9	483 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276		B4E171	279 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	HSF2BP	O75031	334 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	GLI1	P08151	1106 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	THRA	P10827	490 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	TIMP2	P16035	220 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	MPST	P25325	297 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	TSPAN7	P41732	249 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	ABHD18	Q0P651	414 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	NR1D2	Q14995	579 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	MYLK3	Q32MK0	819 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	LRRC31	Q6UY01	552 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	WDCP	Q9H6R7	721 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	FGF22	Q9HCT0	170 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	PIGV	Q9NUD9	493 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
FAM53C-208	ENST00000511276	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM202	A6NGA9	273 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	ZW10	O43264	779 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	GSR	P00390	522 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	PDGFA	P04085	211 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	PCCB	P05166	539 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	GNA12	Q03113	381 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	PDCL	Q13371	301 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	ARTN	Q5T4W7	220 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	RRAGA	Q7L523	313 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	BMPER	Q8N8U9	685 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	SNX21	Q969T3	373 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC35C1	Q96A29	364 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	CTRC	Q99895	268 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	DONSON	Q9NYP3	566 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	TLK1	Q9UKI8	766 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	F8	P00451	2351 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	SRGAP2	O75044	1071 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	RFPL1	O75677	317 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	CSF2RB	P32927	897 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	GPR3	P46089	330 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	FMO5	P49326	533 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	DPYD	Q12882	1025 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	MTM1	Q13496	603 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	MEA1	Q16626	185 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	PRR7	Q8TB68	274 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	C1orf74	Q96LT6	269 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	MED7	O43513	233 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	STK17B	O94768	372 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	LDLR	P01130	860 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	FURIN	P09958	794 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	F8A1	P23610	371 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	ACVRL1	P37023	503 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	CXCR3	P49682	368 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
FAM53C-208	ENST00000511276	SQSTM1	Q13501	440 aa		13.31	□□□□□ -0.28

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