RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 IL12RB2Q99665 862 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 HAUS4Q9H6D7 363 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 SATB2Q9UPW6 733 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP12.76□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 WASH4PA8MWX3 477 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 TMCO5BA8MYB1 307 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 CCDC172P0C7W6 258 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 TSHRP16473 764 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 RGRP47804 291 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 NR0B2Q15466 257 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 ISXQ2M1V0 245 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 WSCD2Q2TBF2 565 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 C3orf38Q5JPI3 329 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 FAXCQ5TGI0 409 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 ACAD10Q6JQN1 1059 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 ZSCAN30Q86W11 494 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 MCOLN2Q8IZK6 566 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 SLC39A7Q92504 469 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 ARHGEF26Q96DR7 871 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 NCAPGQ9BPX3 1015 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 CNPY3Q9BT09 278 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 BOCQ9BWV1 1114 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 LRRC19Q9H756 370 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 PDFQ9HBH1 243 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 USP29Q9HBJ7 922 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 CPNE5Q9HCH3 593 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 PCDH12Q9NPG4 1184 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 ASCL3Q9NQ33 180 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 SPASTQ9UBP0 616 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 DKK3Q9UBP4 350 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 SALL4Q9UJQ4 1053 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 YY2O15391 372 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 ANXA6P08133 673 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 LSSP48449 732 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 TPI1P60174 286 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 RAD51Q06609 339 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 PTK2BQ14289 1009 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 PARP15Q460N3 678 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 TMEM52BQ4KMG9 183 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 DCUN1D2Q6PH85 259 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 PCSK4Q6UW60 755 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 MACC1Q6ZN28 852 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 GPR155Q7Z3F1 870 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 ZNF248Q8NDW4 579 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 BTN2A2Q8WVV5 523 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 PEBP4Q96S96 227 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 SLC13A1Q9BZW2 595 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 TRIM7Q9C029 511 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 SLC39A8Q9C0K1 460 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 SIRPGQ9P1W8 387 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 AP4E1Q9UPM8 1137 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 OR1A2Q9Y585 309 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 CFAP46Q8IYW2 2715 aa12.73□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 ANKRD62A6NC57 917 aa12.73□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 LMO7DNF2Z398 122 aa12.73□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP12.73□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 TPP1O14773 563 aa12.73□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 ARHGAP6O43182 974 aa12.73□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 PRAMEF11O60813 436 aa12.73□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 DXOO77932 396 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 C6P13671 934 aa12.73□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 XPAP23025 273 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 LIG3P49916 1009 aa12.73□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 YPEL5P62699 121 aa12.73□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 PPARDQ03181 441 aa12.73□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 INPP5AQ14642 412 aa12.73□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 LRRC14Q15048 493 aa12.73□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 UGP2Q16851 508 aa12.73□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 ALG11Q2TAA5 492 aa12.73□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa12.73□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 FOXR1Q6PIV2 292 aa12.73□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa12.73□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 RD3Q7Z3Z2 195 aa12.73□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 CAMK1DQ8IU85 385 aa12.73□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 HID1Q8IV36 788 aa12.73□□□□□ -0.37
PRAME-212ENST00000485532 TP53INP2Q8IXH6 220 aa12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms