RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466636.1

SRPRB-202, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene SRPRB, Length 917 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-202ENST00000466636 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 SGSM3Q96HU1 749 aa9.6□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 FAM167BQ9BTA0 163 aa9.6□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 TM6SF2Q9BZW4 377 aa9.6□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 CEP44Q9C0F1 390 aa9.6□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 S1PR5Q9H228 398 aa9.6□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa9.6□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 CLEC1BQ9P126 229 aa9.6□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 CDH7Q9ULB5 785 aa9.6□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 KCTD3Q9Y597 815 aa9.6□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 DOCK4Q8N1I0 1966 aa9.6□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 GOLGA8TH3BQL2 631 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 TRIM24O15164 1050 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 SLC7A4O43246 635 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 ZWINTO95229 277 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 PGLSO95336 258 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 ASMTLO95671 621 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 IGSF6O95976 241 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 ADH1CP00326 375 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 GSRP00390 522 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 F7P08709 466 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 PIRTP0C851 137 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 ADH5P11766 374 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 ARSAP15289 507 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 CA4P22748 312 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 GABRB3P28472 473 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 SPRP35270 261 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 MAPK8P45983 427 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 PRSS12P56730 875 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 SULT2A1Q06520 285 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 GEN1Q17RS7 908 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM215Q68D42 235 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 MBLAC2Q68D91 279 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 TRIM68Q6AZZ1 485 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 NEPROQ6NW34 567 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 C12orf40Q86WS4 652 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 AHI1Q8N157 1196 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 TTC30BQ8N4P2 665 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 OR2AP1Q8NGE2 309 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 TCP10LQ8TDR4 215 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 ACMSDQ8TDX5 336 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 CKAP2Q8WWK9 683 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 RMDN1Q96DB5 314 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 MYO19Q96H55 970 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 MRGPRX3Q96LB0 322 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 SMIM14Q96QK8 99 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 FAM83CQ9BQN1 747 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 ADGRE3Q9BY15 652 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 EPN3Q9H201 632 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 TNKS2Q9H2K2 1166 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 MFSD1Q9H3U5 465 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF576Q9H609 170 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 MLXIPLQ9NP71 852 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 TXNDC16Q9P2K2 825 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 SLC25A13Q9UJS0 675 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 ARL5AQ9Y689 179 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 GBF1Q92538 1859 aa9.59□□□□□ -0.87
SRPRB-202ENST00000466636 NOTCH4Q99466 2003 aa9.58□□□□□ -0.88
SRPRB-202ENST00000466636 GMNCA6NCL1 334 aa9.58□□□□□ -0.88
SRPRB-202ENST00000466636 ANKRD66B4E2M5 251 aa9.58□□□□□ -0.88
SRPRB-202ENST00000466636 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SRPRB-202ENST00000466636 COPEO14579 308 aa9.58□□□□□ -0.88
SRPRB-202ENST00000466636 TPP1O14773 563 aa9.58□□□□□ -0.88
SRPRB-202ENST00000466636 AURKAO14965 403 aa9.58□□□□□ -0.88
SRPRB-202ENST00000466636 TM9SF1O15321 606 aa9.58□□□□□ -0.88
SRPRB-202ENST00000466636 TIMM44O43615 452 aa9.58□□□□□ -0.88
SRPRB-202ENST00000466636 SOCS5O75159 536 aa9.58□□□□□ -0.88
SRPRB-202ENST00000466636 TBX10O75333 385 aa9.58□□□□□ -0.88
SRPRB-202ENST00000466636 RPP40O75818 363 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SRPRB-202ENST00000466636 NFATC1O95644 943 aa9.58□□□□□ -0.88
SRPRB-202ENST00000466636 CRTAMO95727 393 aa9.58□□□□□ -0.88
SRPRB-202ENST00000466636 AHSGP02765 367 aa9.58□□□□□ -0.88
SRPRB-202ENST00000466636 NUDT7P0C024 238 aa9.58□□□□□ -0.88
SRPRB-202ENST00000466636 DHRS4L1P0CG22 281 aa9.58□□□□□ -0.88
SRPRB-202ENST00000466636 BMP1P13497 986 aa9.58□□□□□ -0.88
SRPRB-202ENST00000466636 GKP32189 559 aa9.58□□□□□ -0.88
SRPRB-202ENST00000466636 SLC8A1P32418 973 aa9.58□□□□□ -0.88
SRPRB-202ENST00000466636 SLC1A2P43004 574 aa9.58□□□□□ -0.88
SRPRB-202ENST00000466636 ETV4P43268 484 aa9.58□□□□□ -0.88
SRPRB-202ENST00000466636 ABCG1P45844 678 aa9.58□□□□□ -0.88
SRPRB-202ENST00000466636 GRIA4P48058 902 aa9.58□□□□□ -0.88
SRPRB-202ENST00000466636 DGKGP49619 791 aa9.58□□□□□ -0.88
SRPRB-202ENST00000466636 SERPINB8P50452 374 aa9.58□□□□□ -0.88
SRPRB-202ENST00000466636 CSRP3P50461 194 aa9.58□□□□□ -0.88
SRPRB-202ENST00000466636 SEC24CP53992 1094 aa9.58□□□□□ -0.88
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