RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466159.6

SYNE1-217, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SYNE1, Length 2,610 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-217ENST00000466159 CCDC28BQ9BUN5 200 aa9□□□□□ -0.97
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SYNE1-217ENST00000466159 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
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SYNE1-217ENST00000466159 MARCH2Q9P0N8 246 aa9□□□□□ -0.97
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SYNE1-217ENST00000466159 EP400NLQ6ZTU2 488 aa9□□□□□ -0.97
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SYNE1-217ENST00000466159 S1PR4O95977 384 aa8.99□□□□□ -0.97
SYNE1-217ENST00000466159 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SYNE1-217ENST00000466159 OR1E1P30953 314 aa8.99□□□□□ -0.97
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SYNE1-217ENST00000466159 NPAS2Q99743 824 aa8.99□□□□□ -0.97
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