RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 EMP3P54852 163 aa22.28■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC14A2Q15849 920 aa22.28■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 PPP4R4Q6NUP7 873 aa22.28■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 TAC4Q86UU9 113 aa22.28■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 ATPAF2Q8N5M1 289 aa22.28■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 PRKD2Q9BZL6 878 aa22.28■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 ARMC1Q9NVT9 282 aa22.28■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 MATN3O15232 486 aa22.28■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 MAFKO60675 156 aa22.28■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 SRP72O76094 671 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 BMP2P12643 396 aa22.28■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 CYP2C18P33260 490 aa22.28■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 LHX1P48742 406 aa22.28■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 NEPROQ6NW34 567 aa22.28■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 MYO1HQ8N1T3 1032 aa22.28■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 SENP8Q96LD8 212 aa22.28■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 CYP4F12Q9HCS2 524 aa22.28■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 RBP1P09455 135 aa22.27■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 MYBPC3Q14896 1274 aa22.27■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 NHSL2Q5HYW2 709 aa22.27■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 RANBP10Q6VN20 620 aa22.27■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 OLFM1Q99784 485 aa22.27■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa22.27■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 AURKAO14965 403 aa22.27■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 FGFR3P22607 806 aa22.27■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 EPHX2P34913 555 aa22.27■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.27■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM86AQ8N2M4 240 aa22.27■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.27■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 TMIGD2Q96BF3 282 aa22.27■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 CIB1Q99828 191 aa22.27■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC166P0CW27 439 aa22.27■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 KRT80Q6KB66 452 aa22.27■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 CYP2R1Q6VVX0 501 aa22.27■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 DHFR2Q86XF0 187 aa22.27■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC22A9Q8IVM8 553 aa22.27■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 UBXN10Q96LJ8 280 aa22.27■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 TRMOQ9BU70 441 aa22.27■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa22.27■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 CAAP1Q9H8G2 361 aa22.27■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 TRAF6Q9Y4K3 522 aa22.27■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 NUP205Q92621 2012 aa22.26■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 BMP10O95393 424 aa22.26■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 CLCN5P51795 746 aa22.26■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 ACAP2Q15057 778 aa22.26■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 CYHR1Q6ZMK1 362 aa22.26■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 ROPN1LQ96C74 230 aa22.26■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 GSTO2Q9H4Y5 243 aa22.26■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC8A2Q9UPR5 921 aa22.26■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 HOXC13P31276 330 aa22.26■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa22.26■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 MRGPRX2Q96LB1 330 aa22.26■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 BIRC8Q96P09 236 aa22.26■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa22.26■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 IRAK4Q9NWZ3 460 aa22.26■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.26■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A0J9YVX5 310 aa22.25■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 GLTPD2A6NH11 291 aa22.25■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 PRKCQQ04759 706 aa22.25■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 ERMP1Q7Z2K6 904 aa22.25■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 FIBCD1Q8N539 461 aa22.25■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 LZTR1Q8N653 840 aa22.25■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 OR2T34Q8NGX1 318 aa22.25■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 OR2T3Q8NH03 318 aa22.25■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa22.25■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.25■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 TFAP2CQ92754 450 aa22.25■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 ZUFSPQ96AP4 578 aa22.25■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM64CA6NLI5 447 aa22.25■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 PLOD2O00469 737 aa22.25■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 F2P00734 622 aa22.25■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 IMPDH1P20839 514 aa22.25■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 CHRNA4P43681 627 aa22.25■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 NDST2P52849 883 aa22.25■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF789Q5FWF6 425 aa22.25■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 PACRGLQ8N7B6 248 aa22.25■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 CALML6Q8TD86 181 aa22.25■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 RNF34Q969K3 372 aa22.25■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 TSPAN17Q96FV3 270 aa22.25■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 SMARCD1Q96GM5 515 aa22.25■■□□□ 1.15
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