RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000054666.10

VAMP3-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP3, Length 2,205 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3-201ENST00000054666 HECTD2Q5U5R9 776 aa8.31□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 ALG1LQ6GMV1 187 aa8.31□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 ATG14Q6ZNE5 492 aa8.31□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 DENND1CQ8IV53 801 aa8.31□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 POU5F2Q8N7G0 328 aa8.31□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 OR7D4Q8NG98 312 aa8.31□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 STON2Q8WXE9 905 aa8.31□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 DEFB118Q96PH6 123 aa8.31□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 MGME1Q9BQP7 344 aa8.31□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 SPON2Q9BUD6 331 aa8.31□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 A0A0D9SEW6 157 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 TARM1B6A8C7 271 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 AURKAO14965 403 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 ADAM12O43184 909 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 COCHO43405 550 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 LDB2O43679 373 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 RPP40O75818 363 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 GJB5O95377 273 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 PSMG1O95456 288 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 CRTAMO95727 393 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 NDST3O95803 873 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 MYCP01106 439 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 RPSAP08865 295 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 SBK3P0C264 359 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 IRF1P10914 325 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 CCNG1P51959 295 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 SESN3P58005 492 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 DNAJB13P59910 316 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 DLG1Q12959 904 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 PLD1Q13393 1074 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 CUL3Q13618 768 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 TAF11Q15544 211 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 C1orf146Q5VVC0 180 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 CHST9Q7L1S5 443 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 RNF135Q8IUD6 432 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 SLC22A9Q8IVM8 553 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 KIRREL3Q8IZU9 778 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 CRIPAKQ8N1N5 446 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 SPATA6LQ8N4H0 392 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 TMEM151AQ8N4L1 468 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 BRSK1Q8TDC3 778 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 SGF29Q96ES7 293 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 MYEOVQ96EZ4 313 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 TMEM169Q96HH4 297 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 IGSF21Q96ID5 467 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 GPR78Q96P69 363 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 OLFM1Q99784 485 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 NUF2Q9BZD4 464 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 CYP4F11Q9HBI6 524 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 MAN1C1Q9NR34 630 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 IGSF5Q9NSI5 407 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 CATSPERZQ9NTU4 200 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 GTSE1Q9NYZ3 720 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 HSFX1Q9UBD0 423 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 PLA2G4CQ9UP65 541 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 VWA7Q9Y334 891 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 YIPF1Q9Y548 306 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 ILVBLA1L0T0 632 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 TRPC5OSA6NMA1 111 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 CCL22O00626 93 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 SLC22A2O15244 555 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 KRT36O76013 467 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 SOD2P04179 222 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 CCDC166P0CW27 439 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 GNAZP19086 355 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 OGNP20774 298 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 PMLP29590 882 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 SLC26A3P40879 764 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 NUMBP49757 651 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 ARSDP51689 593 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 RPS24P62847 133 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 IKBKEQ14164 716 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 NAA25Q14CX7 972 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 ACAP2Q15057 778 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 MUM1Q2TAK8 710 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 TPGS2Q68CL5 300 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 NXNQ6DKJ4 435 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 FBXO27Q8NI29 283 aa8.3□□□□□ -1.08
VAMP3-201ENST00000054666 MAPK15Q8TD08 544 aa8.3□□□□□ -1.08
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