RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623970.1

ARRDC1-AS1-203, ARRDC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ARRDC1-AS1, Length 2,210 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 RGS3P49796 1198 aa28.58■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 FAM161AQ3B820 660 aa28.58■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 USP31Q70CQ4 1352 aa28.57■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 TTC21AQ8NDW8 1320 aa28.56■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 LMOD3Q0VAK6 560 aa28.56■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa28.56■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 PIK3R4Q99570 1358 aa28.56■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ALDH1L2Q3SY69 923 aa28.55■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa28.55■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 DLG5Q8TDM6 1919 aa28.55■■■□□ 2.16
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ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 TRIM27P14373 513 aa28.55■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ZNF428Q96B54 188 aa28.55■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 KIF16BQ96L93 1317 aa28.54■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 IFT57Q9NWB7 429 aa28.54■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 GNAI1P63096 354 aa28.53■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 C8orf34Q49A92 452 aa28.52■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 PEAK1Q9H792 1746 aa28.5■■■□□ 2.15
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.5■■■□□ 2.15
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ZNF853P0CG23 659 aa28.5■■■□□ 2.15
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 KCNA6P17658 529 aa28.5■■■□□ 2.15
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 DDX19BQ9UMR2 479 aa28.49■■■□□ 2.15
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 SULT6B1Q6IMI4 303 aa28.47■■■□□ 2.15
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.46■■■□□ 2.15
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ITPRIPQ8IWB1 547 aa28.46■■■□□ 2.15
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CFAP44Q96MT7 982 aa28.46■■■□□ 2.15
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa28.45■■■□□ 2.15
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 MBIPQ9NS73 344 aa28.45■■■□□ 2.15
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.45■■■□□ 2.14
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 VAMP4O75379 141 aa28.45■■■□□ 2.14
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 AEBP1Q8IUX7 1158 aa28.45■■■□□ 2.14
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.42■■■□□ 2.14
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 TMEM57Q8N5G2 664 aa28.42■■■□□ 2.14
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 PIK3C2AO00443 1686 aa28.42■■■□□ 2.14
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 MAP3K19Q56UN5 1328 aa28.41■■■□□ 2.14
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 SOX12O15370 315 aa28.41■■■□□ 2.14
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 FAM83GA6ND36 823 aa28.41■■■□□ 2.14
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ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 SBNO1A3KN83 1393 aa28.4■■■□□ 2.14
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 TSPYL6Q8N831 410 aa28.39■■■□□ 2.14
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 FLT4P35916 1363 aa28.39■■■□□ 2.14
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa28.39■■■□□ 2.14
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ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ARHGAP45Q92619 1136 aa28.38■■■□□ 2.13
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.37■■■□□ 2.13
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 DCTN1Q14203 1278 aa28.37■■■□□ 2.13
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa28.37■■■□□ 2.13
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 C8orf58Q8NAV2 365 aa28.34■■■□□ 2.13
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 NLRP6P59044 892 aa28.33■■■□□ 2.13
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 USP54Q70EL1 1684 aa28.33■■■□□ 2.13
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 AMPHP49418 695 aa28.33■■■□□ 2.12
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
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ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 KIF24Q5T7B8 1368 aa28.29■■■□□ 2.12
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CHL1O00533 1208 aa28.28■■■□□ 2.12
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.27■■■□□ 2.12
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 MCM10Q7L590 875 aa28.27■■■□□ 2.12
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 SMC5Q8IY18 1101 aa28.26■■■□□ 2.11
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ABTB2Q8N961 1025 aa28.26■■■□□ 2.11
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 PHF8Q9UPP1 1060 aa28.26■■■□□ 2.11
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ABCC4O15439 1325 aa28.25■■■□□ 2.11
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 EYA1Q99502 592 aa28.25■■■□□ 2.11
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 KIAA0232Q92628 1395 aa28.23■■■□□ 2.11
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 NUTM2GQ5VZR2 741 aa28.23■■■□□ 2.11
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 CRB1P82279 1406 aa28.22■■■□□ 2.11
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.22■■■□□ 2.11
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 HOXC9P31274 260 aa28.22■■■□□ 2.11
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 GAS2L2Q8NHY3 880 aa28.19■■■□□ 2.1
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 USP19O94966 1318 aa28.18■■■□□ 2.1
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 FOXO3O43524 673 aa28.18■■■□□ 2.1
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 SEC24BO95487 1268 aa28.17■■■□□ 2.1
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