RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489835.6

PRRT4-205, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-205ENST00000489835 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PRRT4-205ENST00000489835 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PRRT4-205ENST00000489835 MST1RQ04912 1400 aa22.57■■□□□ 1.2
PRRT4-205ENST00000489835 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PRRT4-205ENST00000489835 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.56■■□□□ 1.2
PRRT4-205ENST00000489835 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PRRT4-205ENST00000489835 E9PSI1 815 aa22.56■■□□□ 1.2
PRRT4-205ENST00000489835 RIPK4P57078 832 aa22.56■■□□□ 1.2
PRRT4-205ENST00000489835 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.56■■□□□ 1.2
PRRT4-205ENST00000489835 MSH6P52701 1360 aa22.55■■□□□ 1.2
PRRT4-205ENST00000489835 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.55■■□□□ 1.2
PRRT4-205ENST00000489835 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.54■■□□□ 1.2
PRRT4-205ENST00000489835 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.54■■□□□ 1.2
PRRT4-205ENST00000489835 CCDC27Q2M243 656 aa22.54■■□□□ 1.2
PRRT4-205ENST00000489835 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PRRT4-205ENST00000489835 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.53■■□□□ 1.2
PRRT4-205ENST00000489835 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.53■■□□□ 1.2
PRRT4-205ENST00000489835 NEFMP07197 916 aa22.52■■□□□ 1.2
PRRT4-205ENST00000489835 SBNO1A3KN83 1393 aa22.52■■□□□ 1.2
PRRT4-205ENST00000489835 PLIN1O60240 522 aa22.52■■□□□ 1.2
PRRT4-205ENST00000489835 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PRRT4-205ENST00000489835 WDR63Q8IWG1 891 aa22.52■■□□□ 1.2
PRRT4-205ENST00000489835 FLT4P35916 1363 aa22.51■■□□□ 1.19
PRRT4-205ENST00000489835 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.51■■□□□ 1.19
PRRT4-205ENST00000489835 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PRRT4-205ENST00000489835 DCCP43146 1447 aa22.51■■□□□ 1.19
PRRT4-205ENST00000489835 HOXC9P31274 260 aa22.5■■□□□ 1.19
PRRT4-205ENST00000489835 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PRRT4-205ENST00000489835 NFE2L2Q16236 605 aa22.46■■□□□ 1.19
PRRT4-205ENST00000489835 EYA1Q99502 592 aa22.46■■□□□ 1.19
PRRT4-205ENST00000489835 KIF1AQ12756 1690 aa22.46■■□□□ 1.19
PRRT4-205ENST00000489835 USP54Q70EL1 1684 aa22.46■■□□□ 1.19
PRRT4-205ENST00000489835 GCP02774 474 aa22.46■■□□□ 1.19
PRRT4-205ENST00000489835 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PRRT4-205ENST00000489835 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PRRT4-205ENST00000489835 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PRRT4-205ENST00000489835 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PRRT4-205ENST00000489835 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.44■■□□□ 1.18
PRRT4-205ENST00000489835 BRINP3Q76B58 766 aa22.43■■□□□ 1.18
PRRT4-205ENST00000489835 SLAIN2Q9P270 581 aa22.43■■□□□ 1.18
PRRT4-205ENST00000489835 LTN1O94822 1766 aa22.42■■□□□ 1.18
PRRT4-205ENST00000489835 NFAT5O94916 1531 aa22.42■■□□□ 1.18
PRRT4-205ENST00000489835 BCAR3O75815 825 aa22.42■■□□□ 1.18
PRRT4-205ENST00000489835 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.42■■□□□ 1.18
PRRT4-205ENST00000489835 FAM83GA6ND36 823 aa22.41■■□□□ 1.18
PRRT4-205ENST00000489835 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PRRT4-205ENST00000489835 IP6K1Q92551 441 aa22.41■■□□□ 1.18
PRRT4-205ENST00000489835 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.41■■□□□ 1.18
PRRT4-205ENST00000489835 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PRRT4-205ENST00000489835 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.4■■□□□ 1.18
PRRT4-205ENST00000489835 DCTN1Q14203 1278 aa22.4■■□□□ 1.18
PRRT4-205ENST00000489835 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.4■■□□□ 1.18
PRRT4-205ENST00000489835 CABLES1Q8TDN4 633 aa22.4■■□□□ 1.18
PRRT4-205ENST00000489835 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PRRT4-205ENST00000489835 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.39■■□□□ 1.17
PRRT4-205ENST00000489835 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.39■■□□□ 1.17
PRRT4-205ENST00000489835 ARHGEF10O15013 1369 aa22.38■■□□□ 1.17
PRRT4-205ENST00000489835 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PRRT4-205ENST00000489835 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.38■■□□□ 1.17
PRRT4-205ENST00000489835 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.38■■□□□ 1.17
PRRT4-205ENST00000489835 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.38■■□□□ 1.17
PRRT4-205ENST00000489835 USP19O94966 1318 aa22.37■■□□□ 1.17
PRRT4-205ENST00000489835 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.37■■□□□ 1.17
PRRT4-205ENST00000489835 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PRRT4-205ENST00000489835 NBR1Q14596 966 aa22.36■■□□□ 1.17
PRRT4-205ENST00000489835 ALS2Q96Q42 1657 aa22.35■■□□□ 1.17
PRRT4-205ENST00000489835 RTL1A6NKG5 1358 aa22.35■■□□□ 1.17
PRRT4-205ENST00000489835 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PRRT4-205ENST00000489835 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.35■■□□□ 1.17
PRRT4-205ENST00000489835 SLIT3O75094 1523 aa22.35■■□□□ 1.17
PRRT4-205ENST00000489835 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PRRT4-205ENST00000489835 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.34■■□□□ 1.17
PRRT4-205ENST00000489835 IL16Q14005 1332 aa22.34■■□□□ 1.17
PRRT4-205ENST00000489835 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PRRT4-205ENST00000489835 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.34■■□□□ 1.17
PRRT4-205ENST00000489835 NBPF4Q96M43 638 aa22.34■■□□□ 1.17
PRRT4-205ENST00000489835 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.33■■□□□ 1.17
PRRT4-205ENST00000489835 PXDNQ92626 1479 aa22.33■■□□□ 1.17
PRRT4-205ENST00000489835 KDRP35968 1356 aa22.33■■□□□ 1.16
PRRT4-205ENST00000489835 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
PRRT4-205ENST00000489835 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PRRT4-205ENST00000489835 MCM10Q7L590 875 aa22.32■■□□□ 1.16
PRRT4-205ENST00000489835 CRBNQ96SW2 442 aa22.31■■□□□ 1.16
PRRT4-205ENST00000489835 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.31■■□□□ 1.16
PRRT4-205ENST00000489835 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.3■■□□□ 1.16
PRRT4-205ENST00000489835 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PRRT4-205ENST00000489835 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.29■■□□□ 1.16
PRRT4-205ENST00000489835 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PRRT4-205ENST00000489835 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.28■■□□□ 1.16
PRRT4-205ENST00000489835 CHRNA2Q15822 529 aa22.27■■□□□ 1.16
PRRT4-205ENST00000489835 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PRRT4-205ENST00000489835 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PRRT4-205ENST00000489835 MBIPQ9NS73 344 aa22.26■■□□□ 1.15
PRRT4-205ENST00000489835 GNAI1P63096 354 aa22.26■■□□□ 1.15
PRRT4-205ENST00000489835 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PRRT4-205ENST00000489835 IFT57Q9NWB7 429 aa22.25■■□□□ 1.15
PRRT4-205ENST00000489835 RGPD5Q99666 1765 aa22.25■■□□□ 1.15
PRRT4-205ENST00000489835 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF853P0CG23 659 aa22.25■■□□□ 1.15
PRRT4-205ENST00000489835 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
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