RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438290.2

SOX21-AS1-201, SOX21 antisense divergent transcript 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SOX21-AS1, Length 3,287 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX21-AS1-201ENST00000438290 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
SOX21-AS1-201ENST00000438290 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
SOX21-AS1-201ENST00000438290 F6X3S4 739 aa17.92■□□□□ 0.46
SOX21-AS1-201ENST00000438290 GBP4Q96PP9 640 aa17.92■□□□□ 0.46
SOX21-AS1-201ENST00000438290 HECW2Q9P2P5 1572 aa17.91■□□□□ 0.46
SOX21-AS1-201ENST00000438290 POLKQ9UBT6 870 aa17.91■□□□□ 0.46
SOX21-AS1-201ENST00000438290 KIF16BQ96L93 1317 aa17.91■□□□□ 0.46
SOX21-AS1-201ENST00000438290 MRE11P49959 708 aa17.91■□□□□ 0.46
SOX21-AS1-201ENST00000438290 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
SOX21-AS1-201ENST00000438290 DDX11L8A8MPP1 907 aa17.9■□□□□ 0.46
SOX21-AS1-201ENST00000438290 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
SOX21-AS1-201ENST00000438290 ESPNB1AK53 854 aa17.9■□□□□ 0.46
SOX21-AS1-201ENST00000438290 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
SOX21-AS1-201ENST00000438290 VAMP4O75379 141 aa17.9■□□□□ 0.46
SOX21-AS1-201ENST00000438290 RBM10P98175 930 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
SOX21-AS1-201ENST00000438290 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa17.89■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa17.88■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 USP32Q8NFA0 1604 aa17.88■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 NUTM2GQ5VZR2 741 aa17.87■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 SULT6B1Q6IMI4 303 aa17.87■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 KIF2CQ99661 725 aa17.87■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 FSD2A1L4K1 749 aa17.86■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 NSD2O96028 1365 aa17.86■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 GOLGA6L22H0YM25 854 aa17.85■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 GDPD2Q9HCC8 539 aa17.85■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa17.85■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 NASPP49321 788 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 ABCC11Q96J66 1382 aa17.85■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 AK9Q5TCS8 1911 aa17.85■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 OSCARQ8IYS5 282 aa17.85■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 FOXO3O43524 673 aa17.84■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 PLCB2Q00722 1185 aa17.84■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 RILPL2Q969X0 211 aa17.84■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 MEIS3Q99687 375 aa17.84■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa17.83■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 NFE2L2Q16236 605 aa17.83■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 PIK3C2BO00750 1634 aa17.83■□□□□ 0.45
SOX21-AS1-201ENST00000438290 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa17.83■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 BMP2KLQ5H9B9 411 aa17.82■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 CDC45O75419 566 aa17.82■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 FCHSD2O94868 740 aa17.82■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 AAMPQ13685 434 aa17.82■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 YEATS2Q9ULM3 1422 aa17.82■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 BAG4O95429 457 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 ADGRB2O60241 1585 aa17.81■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 SLC4A2P04920 1241 aa17.81■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 C14orf37Q86TY3 774 aa17.81■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 RAB3GAP1Q15042 981 aa17.8■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa17.8■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 CFAP74Q9C0B2 1584 aa17.8■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 RBM25P49756 843 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 GNAI1P63096 354 aa17.8■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 CYB5RLQ6IPT4 315 aa17.8■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 SLC52A1Q9NWF4 448 aa17.8■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 CD163L1Q9NR16 1453 aa17.8■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa17.79■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 NEK4P51957 841 aa17.79■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 PTPRMP28827 1452 aa17.79■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 SDSP20132 328 aa17.79■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 COG3Q96JB2 828 aa17.79■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 G2E3Q7L622 706 aa17.78■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP17.78■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa17.78■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 MYO5BQ9ULV0 1848 aa17.78■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 CLCN1P35523 988 aa17.78■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa17.78■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 FAM13BQ9NYF5 915 aa17.78■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 SYCE3A1L190 88 aa17.77■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 GCC1Q96CN9 775 aa17.77■□□□□ 0.44
SOX21-AS1-201ENST00000438290 MSNP26038 577 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.43
SOX21-AS1-201ENST00000438290 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa17.77■□□□□ 0.43
SOX21-AS1-201ENST00000438290 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa17.76■□□□□ 0.43
SOX21-AS1-201ENST00000438290 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
SOX21-AS1-201ENST00000438290 ANO2Q9NQ90 1003 aa17.76■□□□□ 0.43
SOX21-AS1-201ENST00000438290 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
SOX21-AS1-201ENST00000438290 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa17.75■□□□□ 0.43
SOX21-AS1-201ENST00000438290 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
SOX21-AS1-201ENST00000438290 ALDH1L2Q3SY69 923 aa17.74■□□□□ 0.43
SOX21-AS1-201ENST00000438290 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms