RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373776.4

TTLL11-202, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 11, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTLL11, Length 2,012 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11-202ENST00000373776 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
TTLL11-202ENST00000373776 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
TTLL11-202ENST00000373776 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
TTLL11-202ENST00000373776 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
TTLL11-202ENST00000373776 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
TTLL11-202ENST00000373776 FMN2Q9NZ56 1722 aa29.17■■■□□ 2.26
TTLL11-202ENST00000373776 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa29.16■■■□□ 2.26
TTLL11-202ENST00000373776 MSH6P52701 1360 aa29.16■■■□□ 2.26
TTLL11-202ENST00000373776 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
TTLL11-202ENST00000373776 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
TTLL11-202ENST00000373776 RIPK4P57078 832 aa29.15■■■□□ 2.26
TTLL11-202ENST00000373776 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
TTLL11-202ENST00000373776 SMC4Q9NTJ3 1288 aa29.15■■■□□ 2.26
TTLL11-202ENST00000373776 SEC24BO95487 1268 aa29.14■■■□□ 2.26
TTLL11-202ENST00000373776 SSH1Q8WYL5 1049 aa29.14■■■□□ 2.26
TTLL11-202ENST00000373776 ATF3P18847 181 aa29.12■■■□□ 2.25
TTLL11-202ENST00000373776 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
TTLL11-202ENST00000373776 CCDC61Q9Y6R9 512 aa29.12■■■□□ 2.25
TTLL11-202ENST00000373776 FCHSD2O94868 740 aa29.11■■■□□ 2.25
TTLL11-202ENST00000373776 TRIM27P14373 513 aa29.11■■■□□ 2.25
TTLL11-202ENST00000373776 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
TTLL11-202ENST00000373776 DCCP43146 1447 aa29.11■■■□□ 2.25
TTLL11-202ENST00000373776 MST1RQ04912 1400 aa29.11■■■□□ 2.25
TTLL11-202ENST00000373776 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa29.11■■■□□ 2.25
TTLL11-202ENST00000373776 POLKQ9UBT6 870 aa29.1■■■□□ 2.25
TTLL11-202ENST00000373776 NFKBIBQ15653 356 aa29.1■■■□□ 2.25
TTLL11-202ENST00000373776 ORAI2Q96SN7 254 aa29.1■■■□□ 2.25
TTLL11-202ENST00000373776 RSPH6AQ9H0K4 717 aa29.09■■■□□ 2.25
TTLL11-202ENST00000373776 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
TTLL11-202ENST00000373776 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.08■■■□□ 2.25
TTLL11-202ENST00000373776 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa29.08■■■□□ 2.25
TTLL11-202ENST00000373776 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa29.08■■■□□ 2.25
TTLL11-202ENST00000373776 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP29.08■■■□□ 2.25
TTLL11-202ENST00000373776 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.07■■■□□ 2.24
TTLL11-202ENST00000373776 ANKARQ7Z5J8 1434 aa29.06■■■□□ 2.24
TTLL11-202ENST00000373776 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.05■■■□□ 2.24
TTLL11-202ENST00000373776 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
TTLL11-202ENST00000373776 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
TTLL11-202ENST00000373776 DDX19BQ9UMR2 479 aa29.04■■■□□ 2.24
TTLL11-202ENST00000373776 FBLN1P23142 703 aa29.04■■■□□ 2.24
TTLL11-202ENST00000373776 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
TTLL11-202ENST00000373776 PRKAR2BP31323 418 aa29.03■■■□□ 2.24
TTLL11-202ENST00000373776 SLAIN2Q9P270 581 aa29.02■■■□□ 2.24
TTLL11-202ENST00000373776 PLEKHG3A1L390 1219 aa29.01■■■□□ 2.23
TTLL11-202ENST00000373776 MON2Q7Z3U7 1717 aa29.01■■■□□ 2.23
TTLL11-202ENST00000373776 ACEP12821 1306 aa29■■■□□ 2.23
TTLL11-202ENST00000373776 KIF16BQ96L93 1317 aa29■■■□□ 2.23
TTLL11-202ENST00000373776 ALDH1L2Q3SY69 923 aa29■■■□□ 2.23
TTLL11-202ENST00000373776 ITPRIPQ8IWB1 547 aa29■■■□□ 2.23
TTLL11-202ENST00000373776 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
TTLL11-202ENST00000373776 TMEM57Q8N5G2 664 aa28.99■■■□□ 2.23
TTLL11-202ENST00000373776 PHF8Q9UPP1 1060 aa28.99■■■□□ 2.23
TTLL11-202ENST00000373776 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
TTLL11-202ENST00000373776 ITSN1Q15811 1721 aa28.98■■■□□ 2.23
TTLL11-202ENST00000373776 NFE2L2Q16236 605 aa28.98■■■□□ 2.23
TTLL11-202ENST00000373776 CERKQ8TCT0 537 aa28.98■■■□□ 2.23
TTLL11-202ENST00000373776 AATKQ6ZMQ8 1374 aa28.97■■■□□ 2.23
TTLL11-202ENST00000373776 AKAP12Q02952 1782 aa28.96■■■□□ 2.23
TTLL11-202ENST00000373776 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
TTLL11-202ENST00000373776 PHACTR3Q96KR7 559 aa28.96■■■□□ 2.23
TTLL11-202ENST00000373776 TBC1D32Q96NH3 1257 aa28.96■■■□□ 2.23
TTLL11-202ENST00000373776 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa28.96■■■□□ 2.23
TTLL11-202ENST00000373776 FOXO3O43524 673 aa28.96■■■□□ 2.23
TTLL11-202ENST00000373776 IL13P35225 146 aa28.96■■■□□ 2.23
TTLL11-202ENST00000373776 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
TTLL11-202ENST00000373776 BRINP3Q76B58 766 aa28.96■■■□□ 2.23
TTLL11-202ENST00000373776 NME9Q86XW9 330 aa28.96■■■□□ 2.23
TTLL11-202ENST00000373776 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.96■■■□□ 2.23
TTLL11-202ENST00000373776 SMC5Q8IY18 1101 aa28.94■■■□□ 2.22
TTLL11-202ENST00000373776 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
TTLL11-202ENST00000373776 ZNF428Q96B54 188 aa28.94■■■□□ 2.22
TTLL11-202ENST00000373776 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
TTLL11-202ENST00000373776 HMOX1P09601 288 aa28.93■■■□□ 2.22
TTLL11-202ENST00000373776 ZRANB1Q9UGI0 708 aa28.93■■■□□ 2.22
TTLL11-202ENST00000373776 BECN1Q14457 450 aa28.91■■■□□ 2.22
TTLL11-202ENST00000373776 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
TTLL11-202ENST00000373776 DLG5Q8TDM6 1919 aa28.9■■■□□ 2.22
TTLL11-202ENST00000373776 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
TTLL11-202ENST00000373776 USP6P35125 1406 aa28.88■■■□□ 2.21
TTLL11-202ENST00000373776 ZNF853P0CG23 659 aa28.87■■■□□ 2.21
TTLL11-202ENST00000373776 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.87■■■□□ 2.21
TTLL11-202ENST00000373776 VAMP4O75379 141 aa28.87■■■□□ 2.21
TTLL11-202ENST00000373776 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
TTLL11-202ENST00000373776 GSE1Q14687 1217 aa28.87■■■□□ 2.21
TTLL11-202ENST00000373776 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
TTLL11-202ENST00000373776 IFT57Q9NWB7 429 aa28.87■■■□□ 2.21
TTLL11-202ENST00000373776 PIP4K2BP78356 416 aa28.85■■■□□ 2.21
TTLL11-202ENST00000373776 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
TTLL11-202ENST00000373776 COG3Q96JB2 828 aa28.85■■■□□ 2.21
TTLL11-202ENST00000373776 SSH2Q76I76 1423 aa28.84■■■□□ 2.21
TTLL11-202ENST00000373776 GNAI1P63096 354 aa28.84■■■□□ 2.21
TTLL11-202ENST00000373776 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
TTLL11-202ENST00000373776 NRKQ7Z2Y5 1582 aa28.83■■■□□ 2.21
TTLL11-202ENST00000373776 KIF1AQ12756 1690 aa28.83■■■□□ 2.21
TTLL11-202ENST00000373776 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.83■■■□□ 2.21
TTLL11-202ENST00000373776 TOM1O60784 492 aa28.83■■■□□ 2.21
TTLL11-202ENST00000373776 PSME1Q06323 249 aa28.82■■■□□ 2.2
TTLL11-202ENST00000373776 ARHGAP45Q92619 1136 aa28.82■■■□□ 2.2
TTLL11-202ENST00000373776 TSPYL6Q8N831 410 aa28.82■■■□□ 2.2
TTLL11-202ENST00000373776 MBIPQ9NS73 344 aa28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms