RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366973.8

TATDN3-201, Transcript of TatD DNase domain containing 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TATDN3, Length 2,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TATDN3-201ENST00000366973 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
TATDN3-201ENST00000366973 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
TATDN3-201ENST00000366973 SSH2Q76I76 1423 aa18.59■□□□□ 0.57
TATDN3-201ENST00000366973 RGS3P49796 1198 aa18.58■□□□□ 0.57
TATDN3-201ENST00000366973 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
TATDN3-201ENST00000366973 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
TATDN3-201ENST00000366973 NALCNQ8IZF0 1738 aa18.58■□□□□ 0.57
TATDN3-201ENST00000366973 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
TATDN3-201ENST00000366973 DLG5Q8TDM6 1919 aa18.57■□□□□ 0.56
TATDN3-201ENST00000366973 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
TATDN3-201ENST00000366973 TTC21AQ8NDW8 1320 aa18.56■□□□□ 0.56
TATDN3-201ENST00000366973 USP31Q70CQ4 1352 aa18.56■□□□□ 0.56
TATDN3-201ENST00000366973 MVPQ14764 893 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
TATDN3-201ENST00000366973 PEAK1Q9H792 1746 aa18.56■□□□□ 0.56
TATDN3-201ENST00000366973 PIK3R4Q99570 1358 aa18.56■□□□□ 0.56
TATDN3-201ENST00000366973 TRIM27P14373 513 aa18.55■□□□□ 0.56
TATDN3-201ENST00000366973 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
TATDN3-201ENST00000366973 AAMPQ13685 434 aa18.55■□□□□ 0.56
TATDN3-201ENST00000366973 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa18.55■□□□□ 0.56
TATDN3-201ENST00000366973 AEBP1Q8IUX7 1158 aa18.55■□□□□ 0.56
TATDN3-201ENST00000366973 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa18.55■□□□□ 0.56
TATDN3-201ENST00000366973 SULT6B1Q6IMI4 303 aa18.55■□□□□ 0.56
TATDN3-201ENST00000366973 ANKLE2Q86XL3 938 aa18.55■□□□□ 0.56
TATDN3-201ENST00000366973 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
TATDN3-201ENST00000366973 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
TATDN3-201ENST00000366973 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa18.54■□□□□ 0.56
TATDN3-201ENST00000366973 LMOD3Q0VAK6 560 aa18.53■□□□□ 0.56
TATDN3-201ENST00000366973 FAM83GA6ND36 823 aa18.52■□□□□ 0.56
TATDN3-201ENST00000366973 GNAI1P63096 354 aa18.52■□□□□ 0.56
TATDN3-201ENST00000366973 IFT57Q9NWB7 429 aa18.52■□□□□ 0.56
TATDN3-201ENST00000366973 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
TATDN3-201ENST00000366973 ANKARQ7Z5J8 1434 aa18.52■□□□□ 0.56
TATDN3-201ENST00000366973 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
TATDN3-201ENST00000366973 MAP3K19Q56UN5 1328 aa18.52■□□□□ 0.55
TATDN3-201ENST00000366973 FMN2Q9NZ56 1722 aa18.52■□□□□ 0.55
TATDN3-201ENST00000366973 KIF16BQ96L93 1317 aa18.51■□□□□ 0.55
TATDN3-201ENST00000366973 PIK3C2AO00443 1686 aa18.51■□□□□ 0.55
TATDN3-201ENST00000366973 DCTN1Q14203 1278 aa18.51■□□□□ 0.55
TATDN3-201ENST00000366973 ALDH1L2Q3SY69 923 aa18.51■□□□□ 0.55
TATDN3-201ENST00000366973 MBIPQ9NS73 344 aa18.51■□□□□ 0.55
TATDN3-201ENST00000366973 ITPRIPQ8IWB1 547 aa18.5■□□□□ 0.55
TATDN3-201ENST00000366973 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
TATDN3-201ENST00000366973 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
TATDN3-201ENST00000366973 ZNF853P0CG23 659 aa18.5■□□□□ 0.55
TATDN3-201ENST00000366973 FAM161AQ3B820 660 aa18.5■□□□□ 0.55
TATDN3-201ENST00000366973 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
TATDN3-201ENST00000366973 TSPYL6Q8N831 410 aa18.49■□□□□ 0.55
TATDN3-201ENST00000366973 C8orf34Q49A92 452 aa18.49■□□□□ 0.55
TATDN3-201ENST00000366973 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
TATDN3-201ENST00000366973 RGPD1P0DJD0 1748 aa18.48■□□□□ 0.55
TATDN3-201ENST00000366973 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
TATDN3-201ENST00000366973 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
TATDN3-201ENST00000366973 NLRP6P59044 892 aa18.48■□□□□ 0.55
TATDN3-201ENST00000366973 CFAP44Q96MT7 982 aa18.48■□□□□ 0.55
TATDN3-201ENST00000366973 VAMP4O75379 141 aa18.48■□□□□ 0.55
TATDN3-201ENST00000366973 NUTM2GQ5VZR2 741 aa18.48■□□□□ 0.55
TATDN3-201ENST00000366973 TMEM57Q8N5G2 664 aa18.48■□□□□ 0.55
TATDN3-201ENST00000366973 ZNF428Q96B54 188 aa18.48■□□□□ 0.55
TATDN3-201ENST00000366973 DDX19BQ9UMR2 479 aa18.48■□□□□ 0.55
TATDN3-201ENST00000366973 SBNO1A3KN83 1393 aa18.47■□□□□ 0.55
TATDN3-201ENST00000366973 FLT4P35916 1363 aa18.47■□□□□ 0.55
TATDN3-201ENST00000366973 AMPHP49418 695 aa18.46■□□□□ 0.55
TATDN3-201ENST00000366973 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
TATDN3-201ENST00000366973 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
TATDN3-201ENST00000366973 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
TATDN3-201ENST00000366973 ARHGEF10O15013 1369 aa18.44■□□□□ 0.54
TATDN3-201ENST00000366973 MYT1Q01538 1121 aa18.44■□□□□ 0.54
TATDN3-201ENST00000366973 C8orf58Q8NAV2 365 aa18.44■□□□□ 0.54
TATDN3-201ENST00000366973 LMTK3Q96Q04 1460 aa18.44■□□□□ 0.54
TATDN3-201ENST00000366973 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
TATDN3-201ENST00000366973 ABTB2Q8N961 1025 aa18.43■□□□□ 0.54
TATDN3-201ENST00000366973 MCM10Q7L590 875 aa18.43■□□□□ 0.54
TATDN3-201ENST00000366973 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
TATDN3-201ENST00000366973 PHF8Q9UPP1 1060 aa18.43■□□□□ 0.54
TATDN3-201ENST00000366973 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa18.43■□□□□ 0.54
TATDN3-201ENST00000366973 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
TATDN3-201ENST00000366973 C14orf37Q86TY3 774 aa18.42■□□□□ 0.54
TATDN3-201ENST00000366973 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
TATDN3-201ENST00000366973 EYA1Q99502 592 aa18.4■□□□□ 0.54
TATDN3-201ENST00000366973 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa18.4■□□□□ 0.54
TATDN3-201ENST00000366973 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa18.39■□□□□ 0.53
TATDN3-201ENST00000366973 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
TATDN3-201ENST00000366973 IGSF1Q8N6C5 1336 aa18.38■□□□□ 0.53
TATDN3-201ENST00000366973 KDRP35968 1356 aa18.38■□□□□ 0.53
TATDN3-201ENST00000366973 FOXO3O43524 673 aa18.38■□□□□ 0.53
TATDN3-201ENST00000366973 HOXC9P31274 260 aa18.38■□□□□ 0.53
TATDN3-201ENST00000366973 HSPA2P54652 639 aa18.38■□□□□ 0.53
TATDN3-201ENST00000366973 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
TATDN3-201ENST00000366973 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
TATDN3-201ENST00000366973 ARHGAP45Q92619 1136 aa18.38■□□□□ 0.53
TATDN3-201ENST00000366973 USP54Q70EL1 1684 aa18.37■□□□□ 0.53
TATDN3-201ENST00000366973 KRT24Q2M2I5 525 aa18.37■□□□□ 0.53
TATDN3-201ENST00000366973 ESCO1Q5FWF5 840 aa18.37■□□□□ 0.53
TATDN3-201ENST00000366973 CHL1O00533 1208 aa18.37■□□□□ 0.53
TATDN3-201ENST00000366973 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
TATDN3-201ENST00000366973 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
TATDN3-201ENST00000366973 KIF24Q5T7B8 1368 aa18.35■□□□□ 0.53
TATDN3-201ENST00000366973 CRB1P82279 1406 aa18.34■□□□□ 0.53
TATDN3-201ENST00000366973 PSME1Q06323 249 aa18.34■□□□□ 0.53
TATDN3-201ENST00000366973 DDRGK1Q96HY6 314 aa18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms