RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292211.4

UBE2Q1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2Q1, Length 3,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-201ENST00000292211 C3P01024 1663 aa26.74■■□□□ 1.87
UBE2Q1-201ENST00000292211 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
UBE2Q1-201ENST00000292211 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
UBE2Q1-201ENST00000292211 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.71■■□□□ 1.87
UBE2Q1-201ENST00000292211 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
UBE2Q1-201ENST00000292211 KNDC1Q76NI1 1749 aa26.71■■□□□ 1.87
UBE2Q1-201ENST00000292211 KCNA6P17658 529 aa26.7■■□□□ 1.87
UBE2Q1-201ENST00000292211 ITPRIPQ8IWB1 547 aa26.7■■□□□ 1.86
UBE2Q1-201ENST00000292211 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.69■■□□□ 1.86
UBE2Q1-201ENST00000292211 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.69■■□□□ 1.86
UBE2Q1-201ENST00000292211 IL16Q14005 1332 aa26.69■■□□□ 1.86
UBE2Q1-201ENST00000292211 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
UBE2Q1-201ENST00000292211 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
UBE2Q1-201ENST00000292211 GSE1Q14687 1217 aa26.69■■□□□ 1.86
UBE2Q1-201ENST00000292211 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.69■■□□□ 1.86
UBE2Q1-201ENST00000292211 C14orf37Q86TY3 774 aa26.69■■□□□ 1.86
UBE2Q1-201ENST00000292211 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
UBE2Q1-201ENST00000292211 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.68■■□□□ 1.86
UBE2Q1-201ENST00000292211 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.67■■□□□ 1.86
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM83GA6ND36 823 aa26.67■■□□□ 1.86
UBE2Q1-201ENST00000292211 DCTN1Q14203 1278 aa26.67■■□□□ 1.86
UBE2Q1-201ENST00000292211 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.67■■□□□ 1.86
UBE2Q1-201ENST00000292211 ARXQ96QS3 562 aa26.67■■□□□ 1.86
UBE2Q1-201ENST00000292211 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa26.67■■□□□ 1.86
UBE2Q1-201ENST00000292211 MVPQ14764 893 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
UBE2Q1-201ENST00000292211 TRIM27P14373 513 aa26.65■■□□□ 1.86
UBE2Q1-201ENST00000292211 ITSN1Q15811 1721 aa26.65■■□□□ 1.86
UBE2Q1-201ENST00000292211 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
UBE2Q1-201ENST00000292211 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
UBE2Q1-201ENST00000292211 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
UBE2Q1-201ENST00000292211 USP6P35125 1406 aa26.63■■□□□ 1.85
UBE2Q1-201ENST00000292211 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.63■■□□□ 1.85
UBE2Q1-201ENST00000292211 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC4A3P48751 1232 aa26.62■■□□□ 1.85
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM161AQ3B820 660 aa26.62■■□□□ 1.85
UBE2Q1-201ENST00000292211 GNAI1P63096 354 aa26.61■■□□□ 1.85
UBE2Q1-201ENST00000292211 AMPHP49418 695 aa26.61■■□□□ 1.85
UBE2Q1-201ENST00000292211 NLRP6P59044 892 aa26.61■■□□□ 1.85
UBE2Q1-201ENST00000292211 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.61■■□□□ 1.85
UBE2Q1-201ENST00000292211 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.61■■□□□ 1.85
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLIT1O75093 1534 aa26.61■■□□□ 1.85
UBE2Q1-201ENST00000292211 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
UBE2Q1-201ENST00000292211 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.6■■□□□ 1.85
UBE2Q1-201ENST00000292211 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
UBE2Q1-201ENST00000292211 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.6■■□□□ 1.85
UBE2Q1-201ENST00000292211 TSPYL6Q8N831 410 aa26.58■■□□□ 1.85
UBE2Q1-201ENST00000292211 MBIPQ9NS73 344 aa26.58■■□□□ 1.85
UBE2Q1-201ENST00000292211 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.84
UBE2Q1-201ENST00000292211 KIF16BQ96L93 1317 aa26.57■■□□□ 1.84
UBE2Q1-201ENST00000292211 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.57■■□□□ 1.84
UBE2Q1-201ENST00000292211 AKAP12Q02952 1782 aa26.56■■□□□ 1.84
UBE2Q1-201ENST00000292211 DDX19BQ9UMR2 479 aa26.56■■□□□ 1.84
UBE2Q1-201ENST00000292211 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.55■■□□□ 1.84
UBE2Q1-201ENST00000292211 AAMPQ13685 434 aa26.55■■□□□ 1.84
UBE2Q1-201ENST00000292211 IFT57Q9NWB7 429 aa26.55■■□□□ 1.84
UBE2Q1-201ENST00000292211 MCM10Q7L590 875 aa26.54■■□□□ 1.84
UBE2Q1-201ENST00000292211 ABTB2Q8N961 1025 aa26.54■■□□□ 1.84
UBE2Q1-201ENST00000292211 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
UBE2Q1-201ENST00000292211 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
UBE2Q1-201ENST00000292211 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.53■■□□□ 1.84
UBE2Q1-201ENST00000292211 C8orf34Q49A92 452 aa26.53■■□□□ 1.84
UBE2Q1-201ENST00000292211 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.53■■□□□ 1.84
UBE2Q1-201ENST00000292211 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.52■■□□□ 1.84
UBE2Q1-201ENST00000292211 PTCH1Q13635 1447 aa26.52■■□□□ 1.84
UBE2Q1-201ENST00000292211 VAMP4O75379 141 aa26.52■■□□□ 1.84
UBE2Q1-201ENST00000292211 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.51■■□□□ 1.83
UBE2Q1-201ENST00000292211 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.51■■□□□ 1.83
UBE2Q1-201ENST00000292211 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.51■■□□□ 1.83
UBE2Q1-201ENST00000292211 CFAP44Q96MT7 982 aa26.51■■□□□ 1.83
UBE2Q1-201ENST00000292211 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
UBE2Q1-201ENST00000292211 C8orf58Q8NAV2 365 aa26.5■■□□□ 1.83
UBE2Q1-201ENST00000292211 DIP2AQ14689 1571 aa26.49■■□□□ 1.83
UBE2Q1-201ENST00000292211 USP35Q9P2H5 1018 aa26.48■■□□□ 1.83
UBE2Q1-201ENST00000292211 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
UBE2Q1-201ENST00000292211 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
UBE2Q1-201ENST00000292211 ESCO1Q5FWF5 840 aa26.46■■□□□ 1.83
UBE2Q1-201ENST00000292211 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
UBE2Q1-201ENST00000292211 FOXO3O43524 673 aa26.45■■□□□ 1.82
UBE2Q1-201ENST00000292211 KRT24Q2M2I5 525 aa26.45■■□□□ 1.82
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF428Q96B54 188 aa26.44■■□□□ 1.82
UBE2Q1-201ENST00000292211 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.44■■□□□ 1.82
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF853P0CG23 659 aa26.44■■□□□ 1.82
UBE2Q1-201ENST00000292211 PHF8Q9UPP1 1060 aa26.44■■□□□ 1.82
UBE2Q1-201ENST00000292211 NFKBIBQ15653 356 aa26.43■■□□□ 1.82
UBE2Q1-201ENST00000292211 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.43■■□□□ 1.82
UBE2Q1-201ENST00000292211 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
UBE2Q1-201ENST00000292211 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.43■■□□□ 1.82
UBE2Q1-201ENST00000292211 DDRGK1Q96HY6 314 aa26.43■■□□□ 1.82
UBE2Q1-201ENST00000292211 FLT4P35916 1363 aa26.42■■□□□ 1.82
UBE2Q1-201ENST00000292211 USP31Q70CQ4 1352 aa26.42■■□□□ 1.82
UBE2Q1-201ENST00000292211 C1orf115Q9H7X2 142 aa26.42■■□□□ 1.82
UBE2Q1-201ENST00000292211 PSME1Q06323 249 aa26.42■■□□□ 1.82
UBE2Q1-201ENST00000292211 EYA1Q99502 592 aa26.42■■□□□ 1.82
UBE2Q1-201ENST00000292211 RBM10P98175 930 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
UBE2Q1-201ENST00000292211 SSH2Q76I76 1423 aa26.41■■□□□ 1.82
UBE2Q1-201ENST00000292211 SBNO1A3KN83 1393 aa26.39■■□□□ 1.82
UBE2Q1-201ENST00000292211 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa26.39■■□□□ 1.82
UBE2Q1-201ENST00000292211 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms