RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000195173.8

SEMA5B-201, Transcript of semaphorin 5B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SEMA5B, Length 4,523 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5B-201ENST00000195173 SNX21Q969T3 373 aa18.31■□□□□ 0.52
SEMA5B-201ENST00000195173 ABCC11Q96J66 1382 aa18.31■□□□□ 0.52
SEMA5B-201ENST00000195173 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
SEMA5B-201ENST00000195173 TXNDC2Q86VQ3 553 aa18.31■□□□□ 0.52
SEMA5B-201ENST00000195173 PDCL3Q9H2J4 239 aa18.31■□□□□ 0.52
SEMA5B-201ENST00000195173 MAGI2Q86UL8 1455 aa18.31■□□□□ 0.52
SEMA5B-201ENST00000195173 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
SEMA5B-201ENST00000195173 LRRCC1Q9C099 1032 aa18.31■□□□□ 0.52
SEMA5B-201ENST00000195173 FAM184AQ8NB25 1140 aa18.3■□□□□ 0.52
SEMA5B-201ENST00000195173 F6X3S4 739 aa18.3■□□□□ 0.52
SEMA5B-201ENST00000195173 RAPGEF3O95398 923 aa18.3■□□□□ 0.52
SEMA5B-201ENST00000195173 NUTM2GQ5VZR2 741 aa18.3■□□□□ 0.52
SEMA5B-201ENST00000195173 GNAI3P08754 354 aa18.3■□□□□ 0.52
SEMA5B-201ENST00000195173 WAPLQ7Z5K2 1190 aa18.3■□□□□ 0.52
SEMA5B-201ENST00000195173 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SEMA5B-201ENST00000195173 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SEMA5B-201ENST00000195173 ADAMTS12P58397 1594 aa18.29■□□□□ 0.52
SEMA5B-201ENST00000195173 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
SEMA5B-201ENST00000195173 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
SEMA5B-201ENST00000195173 TSPYL6Q8N831 410 aa18.28■□□□□ 0.52
SEMA5B-201ENST00000195173 MBIPQ9NS73 344 aa18.28■□□□□ 0.52
SEMA5B-201ENST00000195173 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
SEMA5B-201ENST00000195173 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
SEMA5B-201ENST00000195173 INSRP06213 1382 aa18.28■□□□□ 0.52
SEMA5B-201ENST00000195173 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
SEMA5B-201ENST00000195173 ATAD2Q6PL18 1390 aa18.27■□□□□ 0.52
SEMA5B-201ENST00000195173 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
SEMA5B-201ENST00000195173 TEFQ10587 303 aa18.27■□□□□ 0.52
SEMA5B-201ENST00000195173 NME9Q86XW9 330 aa18.27■□□□□ 0.52
SEMA5B-201ENST00000195173 FYB1O15117 783 aa18.27■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 TRIM5Q9C035 493 aa18.27■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 USP25Q9UHP3 1055 aa18.27■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 SHANK2Q9UPX8 1470 aa18.26■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.26■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 TTC22Q5TAA0 569 aa18.26■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 MBD5Q9P267 1494 aa18.26■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 SDSP20132 328 aa18.26■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 SASS6Q6UVJ0 657 aa18.26■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 USP19O94966 1318 aa18.26■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa18.26■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 ANTXR1Q9H6X2 564 aa18.25■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 NUTM1Q86Y26 1132 aa18.25■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 CNTROBQ8N137 903 aa18.24■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 CCT4P50991 539 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 RBM25P49756 843 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 C8orf58Q8NAV2 365 aa18.23■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 CCDC30Q5VVM6 783 aa18.23■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 GAS2L3Q86XJ1 694 aa18.23■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 HDAC5Q9UQL6 1122 aa18.23■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 IL16Q14005 1332 aa18.23■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 IDI1Q13907 227 aa18.23■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa18.22■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 CHMP4AQ9BY43 222 aa18.22■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 FERMT3Q86UX7 667 aa18.22■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa18.22■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 MX1P20591 662 aa18.21■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 MEIS3Q99687 375 aa18.21■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 NPHP1O15259 732 aa18.21■□□□□ 0.51
SEMA5B-201ENST00000195173 TMX3Q96JJ7 454 aa18.21■□□□□ 0.5
SEMA5B-201ENST00000195173 PHACTR3Q96KR7 559 aa18.21■□□□□ 0.5
SEMA5B-201ENST00000195173 VAMP4O75379 141 aa18.2■□□□□ 0.5
SEMA5B-201ENST00000195173 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SEMA5B-201ENST00000195173 SLC52A1Q9NWF4 448 aa18.2■□□□□ 0.5
SEMA5B-201ENST00000195173 CBX1P83916 185 aa18.2■□□□□ 0.5
SEMA5B-201ENST00000195173 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP18.2■□□□□ 0.5
SEMA5B-201ENST00000195173 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa18.2■□□□□ 0.5
SEMA5B-201ENST00000195173 TPM4P67936 248 aa18.2■□□□□ 0.5
SEMA5B-201ENST00000195173 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SEMA5B-201ENST00000195173 STK3Q13188 491 aa18.2■□□□□ 0.5
SEMA5B-201ENST00000195173 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SEMA5B-201ENST00000195173 KRT24Q2M2I5 525 aa18.19■□□□□ 0.5
SEMA5B-201ENST00000195173 GORABQ5T7V8 394 aa18.19■□□□□ 0.5
SEMA5B-201ENST00000195173 RNF20Q5VTR2 975 aa18.19■□□□□ 0.5
SEMA5B-201ENST00000195173 TRIM35Q9UPQ4 493 aa18.19■□□□□ 0.5
SEMA5B-201ENST00000195173 DUOX2Q9NRD8 1548 aa18.19■□□□□ 0.5
SEMA5B-201ENST00000195173 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa18.19■□□□□ 0.5
SEMA5B-201ENST00000195173 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa18.19■□□□□ 0.5
SEMA5B-201ENST00000195173 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
SEMA5B-201ENST00000195173 LRSAM1Q6UWE0 723 aa18.19■□□□□ 0.5
SEMA5B-201ENST00000195173 KIF3AQ9Y496 699 aa18.19■□□□□ 0.5
SEMA5B-201ENST00000195173 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
SEMA5B-201ENST00000195173 SRGAP3O43295 1099 aa18.18■□□□□ 0.5
SEMA5B-201ENST00000195173 CCDC192P0DO97 292 aa18.18■□□□□ 0.5
SEMA5B-201ENST00000195173 RBSNQ9H1K0 784 aa18.18■□□□□ 0.5
SEMA5B-201ENST00000195173 NLRP6P59044 892 aa18.18■□□□□ 0.5
SEMA5B-201ENST00000195173 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa18.18■□□□□ 0.5
SEMA5B-201ENST00000195173 CAMK4Q16566 473 aa18.18■□□□□ 0.5
SEMA5B-201ENST00000195173 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa18.18■□□□□ 0.5
SEMA5B-201ENST00000195173 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms