RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC44A1Q8WWI5 657 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 GTSE1Q9NYZ3 720 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 HEATR9A2RTY3 570 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 ASLP04424 464 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 PDHA1P08559 390 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 CA4P22748 312 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 MSH2P43246 934 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 MESP2Q0VG99 397 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC6Q86X45 466 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP4X1Q8N118 509 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 DCAKDQ8WVC6 231 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 MYLIPQ8WY64 445 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 CERS2Q96G23 380 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 TBK1Q9UHD2 729 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 NUMBLQ9Y6R0 609 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 GRXCR2A6NFK2 248 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 ANHXE9PGG2 379 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 ARNTLO00327 626 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
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CAPNS1-215ENST00000628018 GJA4P35212 333 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 HTR4Q13639 388 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 ACCSLQ4AC99 568 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 PHTF2Q8N3S3 785 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 PPM1NQ8N819 430 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 OR6K2Q8NGY2 324 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 SORCS1Q8WY21 1168 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 VOPP1Q96AW1 172 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 MYO19Q96H55 970 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 ADGRE3Q9BY15 652 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 CIPCQ9C0C6 399 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 TREX1Q9NSU2 369 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-215ENST00000628018 DLDP09622 509 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 OPRD1P41143 372 aa25.07■■□□□ 1.6
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CAPNS1-215ENST00000628018 SEPT6Q14141 434 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 PTPRNQ16849 979 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 SKIDA1Q1XH10 827 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 CARD16Q5EG05 197 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 CTAGE3PQ8IX95 158 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 PLPP6Q8IY26 295 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 RMDN1Q96DB5 314 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 ELOVL2Q9NXB9 296 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 XIRP2A4UGR9 3374 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 MROH6A6NGR9 719 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD66B4E2M5 251 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 PRRT4C9JH25 899 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP5DP30049 168 aa25.07■■□□□ 1.6
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CAPNS1-215ENST00000628018 SLC26A11Q86WA9 606 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 CAMK1DQ8IU85 385 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 LPCAT1Q8NF37 534 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 TTC8Q8TAM2 541 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 BRSK1Q8TDC3 778 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 FRS2Q8WU20 508 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 CDKL2Q92772 493 aa25.07■■□□□ 1.6
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CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC78A2IDD5 438 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 LDB2O43679 373 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 SOCS5O75159 536 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 PGLSO95336 258 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 INHBAP08476 426 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 ERVK-10P10266 1014 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 GKP32189 559 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 NNMTP40261 264 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 NAB1Q13506 487 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 TSTD2Q5T7W7 516 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 NLRP9Q7RTR0 991 aa25.06■■□□□ 1.6
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CAPNS1-215ENST00000628018 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 NXPE3Q969Y0 559 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 CHFRQ96EP1 664 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF180Q9UJW8 692 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 IKBKGQ9Y6K9 419 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 TIMM44O43615 452 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 PIGNO95427 931 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 PRKCGP05129 697 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 SP100P23497 879 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
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