RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565927.1

ATP2C2-208, Transcript of ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 2, human

TSL 4

Gene ATP2C2, Length 548 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP2C2-208	ENST00000565927	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	AREL1	O15033	823 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	PIGN	O95427	931 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	CD160	O95971	181 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	IGFALS	P35858	605 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	NDST2	P52849	883 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	UCN	P55089	124 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	PFN3	P60673	137 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	CXADR	P78310	365 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	BCL2L1	Q07817	233 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	SPIDR	Q14159	915 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	IRF4	Q15306	451 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	GUSBP11	Q6P575	273 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	GKN2	Q86XP6	184 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	RBFA	Q8N0V3	343 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	BBS5	Q8N3I7	341 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	TRIM11	Q96F44	468 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	KL	Q9UEF7	1012 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	MYO6	Q9UM54	1294 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	WASH4P	A8MWX3	477 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	LMO7DN	F2Z398	122 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	RASGRP1	O95267	797 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	PCCB	P05166	539 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	TIMP2	P16035	220 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	KEL	P23276	732 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	ARL4A	P40617	200 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	LSS	P48449	732 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	PEX5	P50542	639 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	RENBP	P51606	427 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	TYRO3	Q06418	890 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	BIRC2	Q13490	618 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	TCEA2	Q15560	299 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	UGP2	Q16851	508 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	ARL14	Q8N4G2	192 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	CENPT	Q96BT3	561 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	ZNF653	Q96CK0	615 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	CRELD1	Q96HD1	420 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	ZWILCH	Q9H900	591 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	GPR27	Q9NS67	375 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	PADI4	Q9UM07	663 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	LAMA5	O15230	3695 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	ITPR1	Q14643	2758 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		12.77	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		12.77	□□□□□ -0.36
ATP2C2-208	ENST00000565927	INSIG1	O15503	277 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ATP2C2-208	ENST00000565927	SPINT1	O43278	529 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ATP2C2-208	ENST00000565927	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
ATP2C2-208	ENST00000565927	PRAMEF11	O60813	436 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ATP2C2-208	ENST00000565927	TCEA3	O75764	348 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ATP2C2-208	ENST00000565927	SERPINC1	P01008	464 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ATP2C2-208	ENST00000565927	TNF	P01375	233 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ATP2C2-208	ENST00000565927	ELFN1	P0C7U0	828 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ATP2C2-208	ENST00000565927	C6	P13671	934 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ATP2C2-208	ENST00000565927	TSHR	P16473	764 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ATP2C2-208	ENST00000565927	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
ATP2C2-208	ENST00000565927	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
ATP2C2-208	ENST00000565927	TMPRSS3	P57727	454 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ATP2C2-208	ENST00000565927	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ATP2C2-208	ENST00000565927	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ATP2C2-208	ENST00000565927	ZNF235	Q14590	738 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ATP2C2-208	ENST00000565927	CYTH1	Q15438	398 aa		12.77	□□□□□ -0.37

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