RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516582.1

RNU6-638P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 638, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-638P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-638P-201ENST00000516582 GAGE5Q13069 117 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 GAGE6Q13070 117 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 MDGA2Q7Z553 956 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 TRIB2Q92519 343 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 FAM122AQ96E09 287 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 SGF29Q96ES7 293 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 C1RLQ9NZP8 487 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 KCNJ14Q9UNX9 436 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 FAT4Q6V0I7 4981 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 LMTK3Q96Q04 1460 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 H7C4K7 107 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 KIF3BO15066 747 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 KAT7O95251 611 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 PLA2G4BP0C869 781 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 ZNF44P15621 663 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 USP8P40818 1118 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 STAT1P42224 750 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 SHC2P98077 582 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 ACOX1Q15067 660 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 INSCQ1MX18 579 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 KRT79Q5XKE5 535 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 ACSM6Q6P461 480 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 TMEM217Q8N7C4 229 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 POC5Q8NA72 575 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 RHOXF1Q8NHV9 184 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 MRAPQ8TCY5 172 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 GLMPQ8WWB7 406 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 ARHGEF26Q96DR7 871 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 DEPDC7Q96QD5 511 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 LMBRD1Q9NUN5 540 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 PNPOQ9NVS9 261 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 PCDHA6Q9UN73 950 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 MYO16Q9Y6X6 1858 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 A0A087WW49 117 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 TMCC1O94876 653 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 TSHBP01222 138 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 MMP3P08254 477 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 C5AR1P21730 350 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 RBFAQ8N0V3 343 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 PPM1KQ8N3J5 372 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 MPP5Q8N3R9 675 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 GIMAP5Q96F15 307 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 NSMCE3Q96MG7 304 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 PPP1R9BQ96SB3 815 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 STK33Q9BYT3 514 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 HIPK3Q9H422 1215 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 INPP5EQ9NRR6 644 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 OR6C3Q9NZP0 311 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 SEL1LQ9UBV2 794 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 PRODH2Q9UF12 536 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 A0A087WWV3 80 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 TBX3O15119 743 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 NADKO95544 446 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 EML2O95834 649 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 HPP00738 406 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 DRD1P21728 446 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 MDKP21741 143 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 MAPK9P45984 424 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 TAS2R38P59533 333 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 CTBP1Q13363 440 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 KCNT1Q5JUK3 1230 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 FAM90A2PQ658T7 463 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 CKAP2LQ8IYA6 745 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 JADE3Q92613 823 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 NPAS1Q99742 590 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 PANK2Q9BZ23 570 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 RAD21L1Q9H4I0 556 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 SORL1Q92673 2214 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 IDH3BO43837 385 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 AIREO43918 545 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 CLPTM1O96005 669 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 IGLV3-19P01714 112 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 ALADP13716 330 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 VAMP1P23763 118 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 TMPOP42166 694 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 LRRC63Q05C16 580 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 ITGADQ13349 1161 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 ERAP2Q6P179 960 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 MFSD6Q6ZSS7 791 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 TSPAN33Q86UF1 283 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-638P-201ENST00000516582 SLC25A42Q86VD7 318 aa-0.9□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms