RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 PCSK1P29120 753 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 CLCN2P51788 898 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 PPP1R3AQ16821 1122 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 PLEKHH3Q7Z736 793 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 ZFP28Q8NHY6 868 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 OLFM1Q99784 485 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 MEAF6Q9HAF1 191 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 FBP2O00757 339 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 PAGE1O75459 146 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 PLK1P53350 603 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 NRF1Q16656 503 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 CCL15Q16663 113 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 TECRLQ5HYJ1 363 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 KLHDC10Q6PID8 442 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 SCAMP5Q8TAC9 235 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 HIC2Q96JB3 615 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 FAR2Q96K12 515 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 A8MT66 165 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 IGLV3-25P01717 112 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 TIGD5Q53EQ6 642 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 AGKQ53H12 422 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 AGAP9Q5VTM2 703 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 OLFML2BQ68BL8 750 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 CUZD1Q86UP6 607 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 LZTR1Q8N653 840 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 LPPQ93052 612 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC126Q96EE4 140 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 RTP3Q9BQQ7 232 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 MRGBPQ9NV56 204 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 PTTG2Q9NZH5 202 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC160A6NGH7 325 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 CASTOR2A6NHX0 329 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 RHDQ02161 417 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 PHF21BQ96EK2 531 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 TLL2Q9Y6L7 1015 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-221ENST00000511747 PRORSD1PA6NEY8 169 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 MYL3P08590 195 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC166P0CW27 439 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 PFKPQ01813 784 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 SQLEQ14534 574 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 MAPRE2Q15555 327 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 MYLK3Q32MK0 819 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 KIAA0408Q6ZU52 694 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 PNPLA1Q8N8W4 532 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 PRKD2Q9BZL6 878 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 C17orf102A2RUQ5 167 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 GPC4O75487 556 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 C8BP07358 591 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 RALGDSQ12967 914 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 PCSK7Q16549 785 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 USP41Q3LFD5 358 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 NOMO2Q5JPE7 1267 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 REP15Q6BDI9 236 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 BRI3BPQ8WY22 251 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC2A11Q9BYW1 496 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 OCEL1Q9H607 264 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 COQ10BQ9H8M1 238 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM105AQ9NUU6 356 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 C7orf72A4D263 438 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 TRIM24O15164 1050 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 IRAK2O43187 625 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 TRPA1O75762 1119 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 CSPG5O95196 566 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 BEX3Q00994 111 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 CREB5Q02930 508 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 PSMD5Q16401 504 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 LRTOMTQ8WZ04 291 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 DTNBP1Q96EV8 351 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 SPAG4Q9NPE6 437 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 SARDHQ9UL12 918 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 APOFQ13790 326 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 LPGAT1Q92604 370 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 TOP1MTQ969P6 601 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF236Q9UL36 1845 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 ARL5CA6NH57 179 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 PSMC3P17980 439 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 HOXC13P31276 330 aa27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms