RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-215	ENST00000498284	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	UCMA	Q8WVF2	138 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	RFFL	Q8WZ73	363 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	OTULIN	Q96BN8	352 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	SAAL1	Q96ER3	474 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	BBS4	Q96RK4	519 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	USP44	Q9H0E7	712 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	EBF3	Q9H4W6	596 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284		A0A0U1RQF3	1178 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284		A0A1W2PPH5	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284		B4E171	279 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	LDLRAD4	O15165	306 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	IRF1	P10914	325 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	TSPAN7	P41732	249 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	HDAC4	P56524	1084 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	PPP2R5B	Q15173	497 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	TXNDC8	Q6A555	127 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	SNAPC3	Q92966	411 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM51	Q9NW97	253 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	MYO6	Q9UM54	1294 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRK-215	ENST00000498284	INSIG1	O15503	277 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	KLK8	O60259	260 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	RGS11	O94810	467 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	ALPL	P05186	524 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	UBL4A	P11441	157 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	MLH1	P40692	756 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	NUDT6	P53370	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284		Q0VFX4	171 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	ST3GAL1	Q11201	340 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	ITGAD	Q13349	1161 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	AASS	Q9UDR5	926 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	IFNL4	K9M1U5	179 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	TAF4	O00268	1085 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	MTA2	O94776	668 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	TF	P02787	698 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	HOXC6	P09630	235 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	SNHG28	P0DPA3	235 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	CPOX	P36551	454 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	GABRB2	P47870	512 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	PCYT1A	P49585	367 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	HTR6	P50406	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	CCR9	P51686	369 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	GRIK3	Q13003	919 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	SHB	Q15464	509 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	GSTA3	Q16772	222 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	NOXA1	Q86UR1	476 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	TDRP	Q86YL5	185 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	METTL6	Q8TCB7	284 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	TRIB2	Q92519	343 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	WAC	Q9BTA9	647 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-215	ENST00000498284	BRF2	Q9HAW0	419 aa		4.57	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms