RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493107.5

SEC22C-216, Transcript of SEC22 homolog C, vesicle trafficking protein, humanhuman

TSL 5

Gene SEC22C, Length 827 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22C-216ENST00000493107 PIGNO95427 931 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 NDST3O95803 873 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 GSRP00390 522 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 GOLGA6DP0CG33 693 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 CREB1P16220 341 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 HLA-DPA1P20036 260 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 KCNA5P22460 613 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 SP100P23497 879 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 ADRA1DP25100 572 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 SLC8A1P32418 973 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 RHOAP61586 193 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 GALNT3Q14435 633 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 PTPRCAPQ14761 206 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 POU6F1Q14863 301 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 RASA2Q15283 850 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 AAK1Q2M2I8 961 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 MYLK3Q32MK0 819 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 SPANXN3Q5MJ09 141 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 AGBL2Q5U5Z8 902 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 C22orf39Q6P5X5 142 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 ADGRD1Q6QNK2 874 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 CAMK1DQ8IU85 385 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 CCNJLQ8IV13 435 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 MDGA1Q8NFP4 955 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 OR2AP1Q8NGE2 309 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 OR13J1Q8NGT2 312 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 SLC44A1Q8WWI5 657 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 PTPRN2Q92932 1015 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 ECHDC3Q96DC8 303 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 NAT9Q9BTE0 207 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 MCMBPQ9BTE3 642 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 MED4Q9NPJ6 270 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 ELOVL2Q9NXB9 296 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 VPS18Q9P253 973 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 SLC17A6Q9P2U8 582 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 TCAF1Q9Y4C2 921 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa9.49□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 A0A0U1RQS6 177 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 TLDC2A0PJX2 215 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 ANKRD66B4E2M5 251 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 GOLGA8KD6RF30 607 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 OPA1O60313 960 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 RNF40O75150 1001 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 SPAG6O75602 509 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 FGF1P05230 155 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 CTSLP07711 333 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 F7P08709 466 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 DLDP09622 509 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 ERVK-10P10266 1014 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 ALADP13716 330 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 OAS2P29728 719 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 SOX9P48436 509 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 ARSDP51689 593 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 AP1S1P61966 158 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 ACVR1Q04771 509 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 KDSRQ06136 332 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 CNGA3Q16281 694 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 KRT71Q3SY84 523 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 CARD16Q5EG05 197 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 EMC10Q5UCC4 262 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 ARMC3Q5W041 872 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 KCTD16Q68DU8 428 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 GRAMD4Q6IC98 578 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 GPR153Q6NV75 609 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF449Q6P9G9 518 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 TXNDC11Q6PKC3 985 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 SH2D5Q6ZV89 423 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 Q6ZVU0 165 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 MTSS1LQ765P7 747 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 EXOC3L1Q86VI1 746 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 TTC30BQ8N4P2 665 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 CPA6Q8N4T0 437 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 TERB1Q8NA31 727 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 BRSK1Q8TDC3 778 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 PGM2Q96G03 612 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 PAFAH2Q99487 392 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 FSD1LQ9BXM9 530 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 TMEM245Q9H330 911 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 OGFRQ9NZT2 677 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 DEC1Q9P2X7 70 aa9.48□□□□□ -0.89
SEC22C-216ENST00000493107 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms