RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 PDHA1P08559 390 aa22.23■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 ELK3P41970 407 aa22.23■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 CRADDP78560 199 aa22.23■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 CERCAMQ5T4B2 595 aa22.23■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 DENND5AQ6IQ26 1287 aa22.23■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF852Q6ZMS4 543 aa22.23■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 FBXO36Q8NEA4 188 aa22.23■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 OR8D1Q8WZ84 308 aa22.23■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 ANKRD7Q92527 254 aa22.23■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 SUV39H2Q9H5I1 410 aa22.23■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 ARNT2Q9HBZ2 717 aa22.23■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 COL4A2P08572 1712 aa22.22■■□□□ 1.15
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PSPC1-204ENST00000492741 SIN3BO75182 1162 aa22.22■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 LEFTY1O75610 366 aa22.22■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 FGF1P05230 155 aa22.22■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 UGT2B4P06133 528 aa22.22■■□□□ 1.15
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PSPC1-204ENST00000492741 C9orf64Q5T6V5 341 aa22.22■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 GDPD4Q6W3E5 623 aa22.22■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 PALM2Q8IXS6 379 aa22.22■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 STK40Q8N2I9 435 aa22.22■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 MPP5Q8N3R9 675 aa22.22■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 LRRC39Q96DD0 335 aa22.22■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 ERLEC1Q96DZ1 483 aa22.22■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 TRIB3Q96RU7 358 aa22.22■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 IL22Q9GZX6 179 aa22.22■■□□□ 1.15
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PSPC1-204ENST00000492741 POU6F1Q14863 301 aa22.21■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 FBXO43Q4G163 708 aa22.21■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 CCDC38Q502W7 563 aa22.21■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 KCNV2Q8TDN2 545 aa22.21■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 SIGLEC10Q96LC7 697 aa22.21■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 ARHGEF3Q9NR81 526 aa22.21■■□□□ 1.15
PSPC1-204ENST00000492741 SYBUQ9NX95 663 aa22.21■■□□□ 1.15
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PSPC1-204ENST00000492741 PRLP01236 227 aa22.2■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 NTSR1P30989 418 aa22.2■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 PRKCQQ04759 706 aa22.2■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
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PSPC1-204ENST00000492741 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
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PSPC1-204ENST00000492741 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa22.2■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 LRIG1Q96JA1 1093 aa22.2■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 KLHL32Q96NJ5 620 aa22.2■■□□□ 1.14
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PSPC1-204ENST00000492741 WNT16Q9UBV4 365 aa22.2■■□□□ 1.14
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PSPC1-204ENST00000492741 ALADP13716 330 aa22.2■■□□□ 1.14
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PSPC1-204ENST00000492741 SEPT6Q14141 434 aa22.2■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 CAPN12Q6ZSI9 719 aa22.2■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP22.2■■□□□ 1.14
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PSPC1-204ENST00000492741 TTC25Q96NG3 672 aa22.2■■□□□ 1.14
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PSPC1-204ENST00000492741 PRSS16Q9NQE7 514 aa22.2■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 WASF2Q9Y6W5 498 aa22.2■■□□□ 1.14
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PSPC1-204ENST00000492741 DSG4Q86SJ6 1040 aa22.19■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 IGDCC3Q8IVU1 814 aa22.19■■□□□ 1.14
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PSPC1-204ENST00000492741 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 VPS37BQ9H9H4 285 aa22.19■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 NINJ2Q9NZG7 142 aa22.19■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
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PSPC1-204ENST00000492741 SHISA7A6NL88 538 aa22.18■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 FZD6O60353 706 aa22.18■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 RNF40O75150 1001 aa22.18■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 CTSLP07711 333 aa22.18■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 PIRTP0C851 137 aa22.18■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 SLC8A1P32418 973 aa22.18■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 RPL26P61254 145 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 ENPP2Q13822 863 aa22.18■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 STARD3Q14849 445 aa22.18■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 POM121L1PQ3SYA9 428 aa22.18■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 PCID2Q5JVF3 399 aa22.18■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 UBALD2Q8IYN6 164 aa22.18■■□□□ 1.14
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