RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 MTSS1O43312 755 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 OIP5O43482 229 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 IGSF6O95976 241 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 GSRP00390 522 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CTSLP07711 333 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ETS1P14921 441 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 AVPR2P30518 371 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CHRNA3P32297 505 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 MAGEA9P43362 315 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CXCL12P48061 93 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 SCNN1BP51168 640 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 COPAP53621 1224 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 DSC2Q02487 901 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF33AQ06730 810 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 NIPAL4Q0D2K0 466 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 STARD3Q14849 445 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 NUMA1Q14980 2115 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 OASLQ15646 514 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 MYLK3Q32MK0 819 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 POM121L1PQ3SYA9 428 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 TEX44Q53QW1 395 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 TTC27Q6P3X3 843 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 TSSK4Q6SA08 328 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PID1Q7Z2X4 250 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CACUL1Q86Y37 369 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF567Q8N184 647 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CNTD1Q8N815 330 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM71DQ8N9W8 422 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 DTWD2Q8NBA8 298 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 OR2AP1Q8NGE2 309 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 OR2T3Q8NH03 318 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 KIF18AQ8NI77 898 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 HMGB4Q8WW32 186 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 OR8D1Q8WZ84 308 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 FATE1Q969F0 183 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 AGAP3Q96P47 875 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PSKH2Q96QS6 385 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 HINFPQ9BQA5 517 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 MGME1Q9BQP7 344 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 HEPHQ9BQS7 1158 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CD248Q9HCU0 757 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 NEUROD4Q9HD90 331 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 IL36AQ9UHA7 158 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 DOCK9Q9BZ29 2069 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CEP192Q8TEP8 1941 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 K7ESF4 209 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PLK4O00444 970 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 LEFTY1O75610 366 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PIGNO95427 931 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 POP4O95707 220 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 IL1BP01584 269 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 GABRG2P18507 467 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 NFKB1P19838 968 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CD68P34810 354 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 COILP38432 576 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PSMD8P48556 350 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PXNP49023 591 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CCR3P51677 355 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 DGKEP52429 567 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 METAP1P53582 386 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 RPS14P62263 151 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 DMWDQ09019 674 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 IHHQ14623 411 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM31Q5JXX7 168 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ANO7Q6IWH7 933 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 NCEH1Q6PIU2 408 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 GSTA5Q7RTV2 222 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 TMPRSS6Q8IU80 811 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 KLHL7Q8IXQ5 586 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 GLIS1Q8NBF1 620 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 TSTD1Q8NFU3 115 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ARRDC2Q8TBH0 407 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC110Q8TBZ0 833 aa8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms