RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460170.2

PTPRU-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,337 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-205ENST00000460170 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 GRK3P35626 688 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 PSMD5Q16401 504 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 CA9Q16790 459 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 FAM187BQ17R55 369 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF621Q6ZSS3 439 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 ANKRD23Q86SG2 305 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 BORCS6Q96GS4 357 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 DNAJC28Q9NX36 388 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 OR6C75A6NL08 312 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 SP2Q02086 613 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 TXNDC11Q6PKC3 985 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 TPGS1Q6ZTW0 290 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 TMEM192Q8IY95 271 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 RGPD2P0DJD1 1756 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 A0A1W2PQH9 124 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 SNTNA6NMZ2 147 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 TCF4P15884 667 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 VCLP18206 1134 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 CCNCP24863 283 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 LMO2P25791 158 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 KLRC2P26717 231 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 XIAPP98170 497 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 HSPA14Q0VDF9 509 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 BNIP2Q12982 314 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 GRM3Q14832 879 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 SCIMPQ6UWF3 145 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 SYT12Q8IV01 421 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 BTN2A3PQ96KV6 586 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 PPP3R2Q96LZ3 170 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 SLC9A7Q96T83 725 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 HMGXB4Q9UGU5 601 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 LRP6O75581 1613 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 RGS5O15539 181 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 ULK1O75385 1050 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 PGM3O95394 542 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 SMPD1P17405 629 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 POLD2P49005 469 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 PQLC1Q8N2U9 271 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 FBXO30Q8TB52 745 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 CLPTM1LQ96KA5 538 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 APOL4Q9BPW4 351 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 SCN11AQ9UI33 1791 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 HDCP19113 662 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 RPL5P46777 297 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 IRF8Q02556 426 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 PWP1Q13610 501 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 DPYSL2Q16555 572 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 C11orf74Q86VG3 221 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 GPR152Q8TDT2 470 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 NXNL1Q96CM4 212 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 ROGDIQ9GZN7 287 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 MCM8Q9UJA3 840 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 CES1P23141 567 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 GSTT1P30711 240 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 HTR7P34969 479 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 UBE3AQ05086 875 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 MAPKAPK3Q16644 382 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 RINLQ6ZS11 566 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 ADHFE1Q8IWW8 467 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 TSPAN14Q8NG11 270 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 PTGES3LE9PB15 166 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 IPO13O94829 963 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 NDUFV1P49821 464 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 SLC7A2P52569 658 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 STARD8Q92502 1023 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 PCED1BQ96HM7 432 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 NPAS2Q99743 824 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 S100A14Q9HCY8 104 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 ADPRHL2Q9NX46 363 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 FZD10Q9ULW2 581 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 PSMD13Q9UNM6 376 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 TPRKBQ9Y3C4 175 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 CATP04040 527 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 IDO1P14902 403 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 PTPN3P26045 913 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 CLCNKBP51801 687 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 DAOAP59103 153 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-205ENST00000460170 FOLH1Q04609 750 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms