RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 EURLQ9NYK6 297 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 SHROOM3Q8TF72 1996 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 HMX2A2RU54 273 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 STAU1O95793 577 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC18A2Q05940 514 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 DPYSQ14117 519 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 PCID2Q5JVF3 399 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 LRMDAQ9H2I8 198 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 VPS28Q9UK41 221 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 BTRCQ9Y297 605 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 KPNA6O60684 536 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 GUCA1CO95843 209 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 OAS1P00973 400 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 RENBPP51606 427 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 KLC1Q07866 573 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 PFKFB4Q16877 469 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 FSCBQ5H9T9 825 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 FBXL22Q6P050 247 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 CAPNS2Q96L46 248 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 CDRT15Q96T59 188 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 TUBB6Q9BUF5 446 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 OSER1Q9NX31 292 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 KCNK4Q9NYG8 393 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 CDYLQ9Y232 598 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 SIN3BO75182 1162 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 TAZQ16635 292 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 CACUL1Q86Y37 369 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 ZYG11BQ9C0D3 744 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 PEX14O75381 377 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 TFEBP19484 476 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 GLDCP23378 1020 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 NPY2RP49146 381 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 GLUD2P49448 558 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 FUT11Q495W5 492 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 AGKQ53H12 422 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM154Q6P9G4 183 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 IZUMO2Q6UXV1 221 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 KLHDC9Q8NEP7 349 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 NPAS2Q99743 824 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 CENPOQ9BU64 300 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 ADAM28Q9UKQ2 775 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 KCNU1A8MYU2 1149 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 HAS3O00219 553 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 SH3BGRLO75368 114 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 KATNA1O75449 491 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 RHOCP08134 193 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 PCLAFQ15004 111 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 RBBP7Q16576 425 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 UGP2Q16851 508 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 DEFB115Q30KQ5 88 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 PKN3Q6P5Z2 889 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 CCNJLQ8IV13 435 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 ICA1LQ8NDH6 482 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 IGSF8Q969P0 613 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 DTNBP1Q96EV8 351 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 RTP3Q9BQQ7 232 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 GABRDO14764 452 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 SRP72O76094 671 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 CYBAP13498 195 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 FGFR3P22607 806 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 HADHAP40939 763 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 ETV4P43268 484 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 LIMK2P53671 638 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 PITRM1Q5JRX3 1037 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 LPCAT4Q643R3 524 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 MON1AQ86VX9 555 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 ULK2Q8IYT8 1036 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 DDI1Q8WTU0 396 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 GM2AP17900 193 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 OXCT1P55809 520 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 STX1BP61266 288 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 GALNTL6Q49A17 601 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 CLLU1OSQ5K130 101 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 TAS1R1Q7RTX1 841 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 SCD5Q86SK9 330 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms