RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 GRIA2P42262 883 aa28.27■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 HSPA13P48723 471 aa28.27■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 TAS2R39P59534 338 aa28.27■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 FAM171BQ6P995 826 aa28.27■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 TRIM67Q6ZTA4 783 aa28.27■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 PELI3Q8N2H9 469 aa28.27■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa28.27■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 ACBD6Q9BR61 282 aa28.27■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa28.27■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 IRAK2O43187 625 aa28.27■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 DNAJA2O60884 412 aa28.27■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 YY1P25490 414 aa28.27■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 DPP6P42658 865 aa28.27■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 MS4A2Q01362 244 aa28.27■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 MANEALQ5VSG8 457 aa28.27■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 ZNF470Q6ECI4 717 aa28.27■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 HEXDCQ8WVB3 486 aa28.27■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 RTP3Q9BQQ7 232 aa28.27■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 FBXO5Q9UKT4 447 aa28.27■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 BEX3Q00994 111 aa28.26■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 OMDQ99983 421 aa28.26■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 SLC39A8Q9C0K1 460 aa28.26■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa28.26■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 M0QZ92 97 aa28.25■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 TRIM38O00635 465 aa28.25■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 ACOT8O14734 319 aa28.25■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 CPB1P15086 417 aa28.25■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 BDNFP23560 247 aa28.25■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 PSMD8P48556 350 aa28.25■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 RAB27AP51159 221 aa28.25■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 MAPRE2Q15555 327 aa28.25■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 PSMD5Q16401 504 aa28.25■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 FAM83EQ2M2I3 478 aa28.25■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 TIGD5Q53EQ6 642 aa28.25■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 RANBP10Q6VN20 620 aa28.25■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 CHSY3Q70JA7 882 aa28.25■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 LRRC49Q8IUZ0 686 aa28.25■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 MARK4Q96L34 752 aa28.25■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 TRPV6Q9H1D0 765 aa28.25■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 TBC1D13Q9NVG8 400 aa28.25■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 MIOSQ9NXC5 875 aa28.25■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 EPS15L1Q9UBC2 864 aa28.25■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 GIT1Q9Y2X7 761 aa28.25■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 ARL5CA6NH57 179 aa28.25■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 UPP1Q16831 310 aa28.25■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 METTL23Q86XA0 190 aa28.25■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 CHST12Q9NRB3 414 aa28.25■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 IGSF5Q9NSI5 407 aa28.25■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 GTSE1Q9NYZ3 720 aa28.25■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 TMEM233B4DJY2 109 aa28.24■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 PAGE1O75459 146 aa28.24■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 HLA-DQB2P05538 268 aa28.24■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 PMLP29590 882 aa28.24■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 PTK2BQ14289 1009 aa28.24■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 NEPROQ6NW34 567 aa28.24■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 SPATA6LQ8N4H0 392 aa28.24■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 CALML6Q8TD86 181 aa28.24■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 NAT14Q8WUY8 206 aa28.24■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 MRGPRX2Q96LB1 330 aa28.24■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP28.24■■■□□ 2.111e-15■■■■■ 44.3
UBP1-201ENST00000283628 CRTAMO95727 393 aa28.23■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 SMIM18P0DKX4 95 aa28.23■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 CCR1P32246 355 aa28.23■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 STX5Q13190 355 aa28.23■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 TECRLQ5HYJ1 363 aa28.23■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 AGAP9Q5VTM2 703 aa28.23■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 NPAS2Q99743 824 aa28.23■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 ABCC13Q9NSE7 274 aa28.23■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 PLK2Q9NYY3 685 aa28.23■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa28.23■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 PATJQ8NI35 1801 aa28.23■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 CASTOR2A6NHX0 329 aa28.23■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 PMPCBO75439 489 aa28.23■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 PFKPQ01813 784 aa28.23■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 SULT2A1Q06520 285 aa28.23■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 AFMIDQ63HM1 303 aa28.23■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 TOP1MTQ969P6 601 aa28.23■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 ASB9Q96DX5 294 aa28.23■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 AP4B1Q9Y6B7 739 aa28.23■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 CYP11A1P05108 521 aa28.22■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 SCNN1GP51170 649 aa28.22■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 CRHR2Q13324 411 aa28.22■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 SQLEQ14534 574 aa28.22■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 KLC3Q6P597 504 aa28.22■■■□□ 2.11
UBP1-201ENST00000283628 CNSTQ6PJW8 725 aa28.22■■■□□ 2.11
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