RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 SARNPP82979 210 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
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CLN8-208ENST00000635751 SH2D5Q6ZV89 423 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 ZNF534Q76KX8 674 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 OTOAQ7RTW8 1153 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 MFSD6LQ8IWD5 586 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 LZTR1Q8N653 840 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 ASIC4Q96FT7 647 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
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CLN8-208ENST00000635751 A0A0A0MRY4 1105 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 STK10O94804 968 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 DHRS4L1P0CG22 281 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 PYGBP11216 843 aa20.23■□□□□ 0.83
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CLN8-208ENST00000635751 UNC5AQ6ZN44 842 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 CHST9Q7L1S5 443 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 CARNMT1Q8N4J0 409 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 KIAA1958Q8N8K9 716 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 GSDMBQ8TAX9 411 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 C10orf82Q8WW14 230 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 IRF7Q92985 503 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 ELSPBP1Q96BH3 223 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 KLHL29Q96CT2 875 aa20.23■□□□□ 0.83
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CLN8-208ENST00000635751 SPATA13Q96N96 652 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 FERMT1Q9BQL6 677 aa20.23■□□□□ 0.83
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CLN8-208ENST00000635751 SLC39A8Q9C0K1 460 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
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CLN8-208ENST00000635751 PLAC1Q9HBJ0 212 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 DONSONQ9NYP3 566 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 EPS15L1Q9UBC2 864 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa20.23■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 MIA3Q5JRA6 1907 aa20.22■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 TRIM49D1C9J1S8 452 aa20.22■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 CYBBP04839 570 aa20.22■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 VAV1P15498 845 aa20.22■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 MAPKAPK2P49137 400 aa20.22■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 CDK16Q00536 496 aa20.22■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 GRM2Q14416 872 aa20.22■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 EML3Q32P44 896 aa20.22■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa20.22■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 LY6G5CQ5SRR4 150 aa20.22■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa20.22■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa20.22■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 ZNF398Q8TD17 642 aa20.22■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 RETREG1Q9H6L5 497 aa20.22■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 TXLNGQ9NUQ3 528 aa20.22■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 WDR91A4D1P6 747 aa20.21■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 H0Y626 953 aa20.21■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 DFFAO00273 331 aa20.21■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 CCNB1P14635 433 aa20.21■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 ETV4P43268 484 aa20.21■□□□□ 0.83
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CLN8-208ENST00000635751 AFMIDQ63HM1 303 aa20.21■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 OR52K2Q8NGK3 314 aa20.21■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 LRRC37BQ96QE4 947 aa20.21■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 LGMNQ99538 433 aa20.21■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 BBS2Q9BXC9 721 aa20.21■□□□□ 0.83
CLN8-208ENST00000635751 MYLK2Q9H1R3 596 aa20.21■□□□□ 0.83
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CLN8-208ENST00000635751 C2CD4DB7Z1M9 353 aa20.2■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa20.2■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 CHUKO15111 745 aa20.2■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 MLNP12872 115 aa20.2■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 ARSAP15289 507 aa20.2■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 PSMC3P17980 439 aa20.2■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 NUMBP49757 651 aa20.2■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 NDST2P52849 883 aa20.2■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 FCHO2Q0JRZ9 810 aa20.2■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 PDK1Q15118 436 aa20.2■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 LEXMQ3ZCV2 418 aa20.2■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 MPP7Q5T2T1 576 aa20.2■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 MTSS1LQ765P7 747 aa20.2■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 ASRGL1Q7L266 308 aa20.2■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 YAF2Q8IY57 180 aa20.2■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 CCNYQ8ND76 341 aa20.2■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 WFDC5Q8TCV5 224 aa20.2■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 MTBPQ96DY7 904 aa20.2■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 FAM83CQ9BQN1 747 aa20.2■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 EBF3Q9H4W6 596 aa20.2■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CLN8-208ENST00000635751 CLEC4EQ9ULY5 219 aa20.2■□□□□ 0.82
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