RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 TBX15Q96SF7 602 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 C1RLQ9NZP8 487 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 FBXO40Q9UH90 709 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAST4O15021 2626 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A1W2PQ72 361 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM233B4DJY2 109 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 HSPB6O14558 160 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM157CP0CG43 387 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 MYF5P13349 255 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 GYS1P13807 737 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 FDPSP14324 419 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 ELK1P19419 428 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 IL15P40933 162 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 RIPK4P57078 832 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 SQSTM1Q13501 440 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 SERINC3Q13530 473 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 ELF2Q15723 593 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 EIPR1Q53HC9 387 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 C10orf76Q5T2E6 689 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM90A2PQ658T7 463 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLEC9AQ6UXN8 241 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 PALB2Q86YC2 1186 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 CD177Q8N6Q3 437 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR52L2PQ8NGH6 319 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 SCRN2Q96FV2 425 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRAC1Q96KF2 57 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 C2orf48Q96LS8 159 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 MXD3Q9BW11 206 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 C14orf119Q9NWQ9 140 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 SNTG2Q9NY99 539 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 IL17BQ9UHF5 180 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 SERPINB13Q9UIV8 391 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 FBXO4Q9UKT5 387 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 SNX9Q9Y5X1 595 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A0G2JLW4 131 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 hDV102S1A0JD36 115 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 CTAGE9A4FU28 777 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF840PA6NDX5 716 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 HAT1O14929 419 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPRIN2O60269 458 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 RASAL1O95294 804 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 VNN2O95498 520 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 TSHBP01222 138 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGKV1-17P01599 117 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 CTAGE8P0CG41 777 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 RBL1P28749 1068 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 PBX1P40424 430 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 DPP6P42658 865 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC37A1P57057 533 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 TFDP3Q5H9I0 405 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 SIRPB2Q5JXA9 342 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 PDSS1Q5T2R2 415 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADCK1Q86TW2 530 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC25Q86WR0 208 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 CTAGE4Q8IX94 777 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 DPP10Q8N608 796 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC20A1Q8WUM9 679 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 GLMPQ8WWB7 406 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 APPBP2Q92624 585 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 STAMQ92783 540 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 BADQ92934 168 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM18Q96B42 140 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 COA7Q96BR5 231 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 PHYHIPLQ96FC7 376 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 MRGPRX1Q96LB2 322 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 DEPDC7Q96QD5 511 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 GMLQ99445 158 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAP3K14Q99558 947 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADPRHL2Q9NX46 363 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC9A2Q9UBY0 812 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAP2CQ9Y3L5 183 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 SMCHD1A6NHR9 2005 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 M0QZQ0 153 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCNN4O15554 427 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 TIPRLO75663 272 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 RFPL2O75678 378 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGHV4-39P01824 125 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 PMELP40967 661 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC16A1P53985 500 aa-0.68□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms