RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393203.2

PTGFRN-201, Transcript of prostaglandin F2 receptor inhibitor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGFRN, Length 6,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRN-201ENST00000393203 DEFB128Q7Z7B8 93 aa15.38■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 MCOLN3Q8TDD5 553 aa15.38■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 CIB1Q99828 191 aa15.38■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 DIP2BQ9P265 1576 aa15.38■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ACSM2AQ08AH3 577 aa15.38■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ACSM2BQ68CK6 577 aa15.38■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 PACS1Q6VY07 963 aa15.38■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 CDK20Q8IZL9 346 aa15.38■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 STAG3L4Q8TBR4 150 aa15.38■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 S100A14Q9HCY8 104 aa15.38■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 UBXN8O00124 270 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 NRP2O60462 931 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 CYP3A4P08684 503 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 NR4A1P22736 598 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 GSTM5P46439 218 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 HSPA14Q0VDF9 509 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ACOX1Q15067 660 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 KIAA0408Q6ZU52 694 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 PDE9AO76083 593 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 GALNT3Q14435 633 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 POM121L1PQ3SYA9 428 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 PYDC2Q56P42 97 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 EXOC2Q96KP1 924 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 BBS4Q96RK4 519 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 MORF4L1Q9UBU8 362 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 OR56A5P0C7T3 313 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 NOS2P35228 1153 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ADCYAP1R1P41586 468 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 MAPKAPK3Q16644 382 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 FAM187BQ17R55 369 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 KRT73Q86Y46 540 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ARL10Q8N8L6 244 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 TCF12Q99081 682 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 KIF20BQ96Q89 1820 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 TPGS1Q6ZTW0 290 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF671Q8TAW3 534 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 VPS35Q96QK1 796 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 B4GALT5O43286 388 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 MT-ND1P03886 318 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 CKBP12277 381 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 CXCL9Q07325 125 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 CERCAMQ5T4B2 595 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 HGSNATQ68CP4 663 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 GAD1Q99259 594 aa15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 IDH3BO43837 385 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ERBB2P04626 1255 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 HPCAL1P37235 193 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 PPM1JQ5JR12 505 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 STXBP5Q5T5C0 1151 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 PALB2Q86YC2 1186 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 SPPL2CQ8IUH8 684 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 SENP8Q96LD8 212 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 KREMEN1Q96MU8 473 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ASB2Q96Q27 587 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 GINS4Q9BRT9 223 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 OSBPL11Q9BXB4 747 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 OSBPL7Q9BZF2 842 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 KLHL31Q9H511 634 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 LMTK2Q8IWU2 1503 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 OR6B1O95007 311 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 BPGMP07738 259 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 UMPSP11172 480 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 TMEM132BQ14DG7 1078 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 PTPN20Q4JDL3 420 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 LRRC38Q5VT99 294 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 BBS12Q6ZW61 710 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 GALNT5Q7Z7M9 940 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 PQLC1Q8N2U9 271 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 GPR156Q8NFN8 814 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 FBXO44Q9H4M3 255 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 C9JVG2 144 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 EPORP19235 508 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 COMMD2Q86X83 199 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 SFRP1Q8N474 314 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 LZTR1Q8N653 840 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 HTRA1Q92743 480 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 NDUFB5O43674 189 aa15.36■□□□□ 0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 BNIP1Q12981 228 aa15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms