RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262539.7

PTPN3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPN3, Length 6,832 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3-201ENST00000262539 FBXO10Q9UK96 956 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 A0A087X1B8 175 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 SUPT3HO75486 399 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 DGKIO75912 1065 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 PCDH8O95206 1070 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 USP17L7P0C7H9 530 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 CCDC159P0C7I6 412 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 FGFR1P11362 822 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 GFAPP14136 432 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 SUOXP51687 545 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 CDC16Q13042 620 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 USP10Q14694 798 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 FAM91A1Q658Y4 838 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 PACS1Q6VY07 963 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 LRRC34Q8IZ02 419 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 ELMO2Q96JJ3 720 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 SPACA7Q96KW9 195 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 RANBP9Q96S59 729 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 LATS2Q9NRM7 1088 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 CD274Q9NZQ7 290 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 WDR90Q96KV7 1748 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 ENPP3O14638 875 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 IQCF3P0C7M6 154 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 RD3Q7Z3Z2 195 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 COLGALT2Q8IYK4 626 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 TBL1YQ9BQ87 522 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 CCDC3Q9BQI4 270 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 POPDC3Q9HBV1 291 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 FBXO5Q9UKT4 447 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 SOAT2O75908 522 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM63AO94886 807 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 ELNP15502 786 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 CRHR1P34998 444 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 RAB33AQ14088 237 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 LVRNQ6Q4G3 990 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 GALNT7Q86SF2 657 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 ANKRD49Q8WVL7 239 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 PPP1R36Q96LQ0 422 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 CCDC90BQ9GZT6 254 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 LZTS1Q9Y250 596 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 TCP11X1B4DZS4 312 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 KPNA5O15131 536 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 RALGDSQ12967 914 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 ATP13A1Q9HD20 1204 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 ZFP69BQ9UJL9 534 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 PAGE1O75459 146 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 CPA3P15088 417 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 NFKB1P19838 968 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 ORC1Q13415 861 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 DPYSQ14117 519 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 CEP68Q76N32 757 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 KIFC1Q9BW19 673 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM248Q9NWD8 314 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 HMGXB4Q9UGU5 601 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 TEX264Q9Y6I9 313 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 DCLK1O15075 740 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 DRD4P21917 467 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 PTPN3P26045 913 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 KCNMB4Q86W47 210 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 JADE3Q92613 823 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 IGSF21Q96ID5 467 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 ING2Q9H160 280 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 NDOR1Q9UHB4 597 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 MYH7BA7E2Y1 1941 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 CCDC78A2IDD5 438 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 IGSF6O95976 241 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 ASLP04424 464 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 KRT20P35900 424 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 TRPC1P48995 793 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 STX5Q13190 355 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 ANKMY2Q8IV38 441 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 PIGVQ9NUD9 493 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM45AQ9NWC5 275 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 CHRNA1P02708 482 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 TACR2P21452 398 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 AVPR1AP37288 418 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 WNT3AP56704 352 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 TLE2Q04725 743 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 TAF10Q12962 218 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPN3-201ENST00000262539 STARD3Q14849 445 aa8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms