RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586940.1

RFX2-206, Transcript of regulatory factor X2, human

TSL 3

Gene RFX2, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RFX2-206	ENST00000586940	CLN3	Q13286	438 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	FZD2	Q14332	565 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	CLEC14A	Q86T13	490 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	LMX1A	Q8TE12	382 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	STK32A	Q8WU08	396 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	BMF	Q96LC9	184 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	SIX2	Q9NPC8	291 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	ACP6	Q9NPH0	428 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	IL36A	Q9UHA7	158 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	FPGT	O14772	594 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	ITGA2B	P08514	1039 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	KRT5	P13647	590 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	JUND	P17535	347 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	CLCN6	P51797	869 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	SPIDR	Q14159	915 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	SYCP1	Q15431	976 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	FIGN	Q5HY92	759 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	XKR5	Q6UX68	686 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	USP53	Q70EK8	1073 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	DEFB106A	Q8N104	65 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	NAT6	Q93015	286 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	FEM1C	Q96JP0	617 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	HDAC8	Q9BY41	377 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	SPAST	Q9UBP0	616 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940		A0A1W2PQJ5	194 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	POM121B	A6NF01	834 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	TPP1	O14773	563 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	MUSK	O15146	869 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	SNAP91	O60641	907 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	MT-CO1	P00395	513 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	RRM1	P23921	792 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	NME3	Q13232	169 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	SGCG	Q13326	291 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	MEA1	Q16626	185 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	ARSI	Q5FYB1	569 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	PERM1	Q5SV97	790 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	TMEM110	Q86TL2	294 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	CNGA4	Q8IV77	575 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	EXD3	Q8N9H8	876 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	CHST14	Q8NCH0	376 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	SHC3	Q92529	594 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	FAM81B	Q96LP2	452 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	SIK2	Q9H0K1	926 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	GPR27	Q9NS67	375 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	VPS51	Q9UID3	782 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	12.81	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940		K7ERQ8	282 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	THAP12	O43422	761 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	LEFTY1	O75610	366 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	GYPC	P04921	128 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	ANXA6	P08133	673 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	GLI1	P08151	1106 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	SFTPC	P11686	197 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	ADRB3	P13945	408 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	GGCX	P38435	758 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	IRAK1	P51617	712 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	INHBC	P55103	352 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	PTK2B	Q14289	1009 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RFX2-206	ENST00000586940	TAF5	Q15542	800 aa		12.8	□□□□□ -0.36

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