RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 STXBP5Q5T5C0 1151 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 RD3Q7Z3Z2 195 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 NR1H2P55055 460 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 SGCGQ13326 291 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF398Q8TD17 642 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 LENG9Q96B70 501 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 SPAG4Q9NPE6 437 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 LGALS2P05162 132 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 ATP6V1C1P21283 382 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 ARCQ7LC44 396 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 PPP1R14AQ96A00 147 aa21.56■■□□□ 1.04
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PTPRM-211ENST00000580170 NDNQ99608 321 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 EPB41L4BQ9H329 900 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 GMEB1Q9Y692 573 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 ADCYAP1R1P41586 468 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 TNK2Q07912 1038 aa21.56■■□□□ 1.04
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PTPRM-211ENST00000580170 C9orf131Q5VYM1 1079 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 GIPC3Q8TF64 312 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 OSBPL6Q9BZF3 934 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 NUAK2Q9H093 628 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa21.55■■□□□ 1.04
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PTPRM-211ENST00000580170 CYP3A7P24462 503 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 GSTM5P46439 218 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 WSCD1Q658N2 575 aa21.55■■□□□ 1.04
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PTPRM-211ENST00000580170 SELENOMQ8WWX9 145 aa21.55■■□□□ 1.04
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PTPRM-211ENST00000580170 TRIM38O00635 465 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 ITGAXP20702 1163 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
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PTPRM-211ENST00000580170 KCTD4Q8WVF5 259 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 PPP1R14BQ96C90 147 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 WDR18Q9BV38 432 aa21.55■■□□□ 1.04
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PTPRM-211ENST00000580170 TMCO1Q9UM00 188 aa21.55■■□□□ 1.04
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PTPRM-211ENST00000580170 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
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PTPRM-211ENST00000580170 CYP2A13Q16696 494 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 OMDQ99983 421 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa21.54■■□□□ 1.04
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PTPRM-211ENST00000580170 NPR3P17342 541 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 CLCN5P51795 746 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa21.54■■□□□ 1.04
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PTPRM-211ENST00000580170 EPS8Q12929 822 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 USP45Q70EL2 814 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 KRT74Q7RTS7 529 aa21.54■■□□□ 1.04
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PTPRM-211ENST00000580170 DNAJB14Q8TBM8 379 aa21.54■■□□□ 1.04
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PTPRM-211ENST00000580170 MARCH2Q9P0N8 246 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 VPS51Q9UID3 782 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 BTN3A3O00478 584 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 PIAS1O75925 651 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 SERPINA6P08185 405 aa21.54■■□□□ 1.04
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PTPRM-211ENST00000580170 KRT77Q7Z794 578 aa21.54■■□□□ 1.04
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PTPRM-211ENST00000580170 CCNB1P14635 433 aa21.54■■□□□ 1.04
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PTPRM-211ENST00000580170 MZT2BQ6NZ67 158 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
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PTPRM-211ENST00000580170 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 H3BMM5 538 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 CXCL11O14625 94 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 ETS2P15036 469 aa21.54■■□□□ 1.04
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PTPRM-211ENST00000580170 RAB10P61026 200 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 SLITRK2Q9H156 845 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 CDH9Q9ULB4 789 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 KLRC2P26717 231 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 PAGE2BQ5JRK9 111 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 SNX6Q9UNH7 406 aa21.53■■□□□ 1.04
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