RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		21.22	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		21.21	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	VILL	O15195	856 aa		21.21	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	PRAMEF11	O60813	436 aa		21.21	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	HCAR3	P49019	387 aa		21.21	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	21.21	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	MYLK3	Q32MK0	819 aa		21.21	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	21.21	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		21.21	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	21.21	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	21.21	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	HSPH1	Q92598	858 aa		21.21	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		21.21	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	21.21	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	21.21	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		21.21	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996		A0A1W2PQU0	124 aa		21.2	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	KRIT1	O00522	736 aa		21.2	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	INSIG1	O15503	277 aa		21.2	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	SPINT1	O43278	529 aa		21.2	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	SH3BP5	O60239	455 aa		21.2	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	21.2	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	CER1	O95813	267 aa		21.2	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	CEACAM1	P13688	526 aa		21.2	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	ADRB3	P13945	408 aa		21.2	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	NEK3	P51956	506 aa		21.2	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	21.2	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	SLC14A1	Q13336	389 aa		21.2	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	ZNF284	Q2VY69	593 aa		21.2	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	BOLA3	Q53S33	107 aa		21.2	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		21.2	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		21.2	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		21.2	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	KLK6	Q92876	244 aa		21.2	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		21.2	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		21.2	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	DYRK4	Q9NR20	520 aa		21.2	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		21.2	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		21.2	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	21.2	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996		H0Y8X5	98 aa		21.19	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	MYO1F	O00160	1098 aa		21.19	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	DAPK3	O43293	454 aa		21.19	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	21.19	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	UGT2B4	P06133	528 aa		21.19	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	PRLR	P16471	622 aa		21.19	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	AMPD1	P23109	780 aa		21.19	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	CD38	P28907	300 aa		21.19	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	ABL2	P42684	1182 aa		21.19	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		21.19	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		21.19	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	21.19	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	HORMAD1	Q86X24	394 aa		21.19	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	TEKT4	Q8WW24	435 aa		21.19	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		21.19	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	TSC1	Q92574	1164 aa		21.19	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		21.19	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	EXOC2	Q96KP1	924 aa		21.19	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		21.19	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	RBSN	Q9H1K0	784 aa		21.19	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		21.19	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		21.19	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	21.19	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	GGT7	Q9UJ14	662 aa		21.19	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		21.19	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		21.18	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		21.18	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		21.18	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		21.18	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996		H3BRJ5	948 aa		21.18	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	ZNF883	P0CG24	379 aa		21.18	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	PML	P29590	882 aa		21.18	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	21.18	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	RHOA	P61586	193 aa		21.18	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	FGL2	Q14314	439 aa		21.18	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		21.18	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		21.18	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		21.18	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	21.18	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	NAXD	Q8IW45	347 aa		21.18	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		21.18	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	21.18	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	21.18	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	DONSON	Q9NYP3	566 aa		21.18	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	ITM2B	Q9Y287	266 aa		21.18	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	FRY	Q5TBA9	3013 aa		21.18	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		21.17	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	DFFA	O00273	331 aa		21.17	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	SLC31A1	O15431	190 aa		21.17	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	AKR1B10	O60218	316 aa		21.17	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	CBFA2T3	O75081	653 aa		21.17	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	PROSC	O94903	275 aa		21.17	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	CD48	P09326	243 aa		21.17	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		21.17	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	IL4R	P24394	825 aa		21.17	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	RGR	P47804	291 aa		21.17	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	ARSE	P51690	589 aa		21.17	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	C21orf59	P57076	290 aa		21.17	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	TAS2R40	P59535	323 aa		21.17	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	SHB	Q15464	509 aa		21.17	■□□□□ 0.98

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms