RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524705.2

BBS1-205, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 3

Gene BBS1, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-205	ENST00000524705	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	ZNF778	Q96MU6	729 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	NAT9	Q9BTE0	207 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	IL22	Q9GZX6	179 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	TRABD	Q9H4I3	376 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	PPCS	Q9HAB8	311 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	TDP1	Q9NUW8	608 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	FETUB	Q9UGM5	382 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	SEPT3	Q9UH03	358 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	VPS28	Q9UK41	221 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	SOX13	Q9UN79	622 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	TMEM120B	A0PK00	339 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	MAGEB16	A2A368	324 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705		K7ERQ8	282 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	AP3B1	O00203	1094 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	INSIG1	O15503	277 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	LINC01565	O15544	149 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	SPAG7	O75391	227 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	USP1	O94782	785 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	TMCC1	O94876	653 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	PRKCG	P05129	697 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	INHBA	P08476	426 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	SERPINF2	P08697	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	BRAF	P15056	766 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	CR2	P20023	1033 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	FSHR	P23945	695 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	ADRA1D	P25100	572 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	HLA-F	P30511	346 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	VIPR2	P41587	438 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	GNGT1	P63211	74 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	CDK18	Q07002	472 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	MGAT5	Q09328	741 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	HYAL1	Q12794	435 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	USP4	Q13107	963 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	NR1H3	Q13133	447 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	BMPR2	Q13873	1038 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	KCNC3	Q14003	757 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	SEPT6	Q14141	434 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	MPP2	Q14168	576 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	GALNT3	Q14435	633 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	RASA2	Q15283	850 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	SLC1A5	Q15758	541 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	MPP7	Q5T2T1	576 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	CYS1	Q717R9	158 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	GPR149	Q86SP6	731 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	TRABD2A	Q86V40	505 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	RASSF3	Q86WH2	238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	LRRC6	Q86X45	466 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	TDH	Q8IZJ6	230 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	NAT16	Q8N8M0	369 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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