RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515588.1

SERF1B-208, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SERF1B, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1B-208ENST00000515588 GRIA4P48058 902 aa16■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 RACK1P63244 317 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 MYLK3Q32MK0 819 aa16■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa16■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 TRIM69Q86WT6 500 aa16■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa16■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 TSC1Q92574 1164 aa16■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 CCDC42Q96M95 316 aa16■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 CSPG4P5Q96PW8 444 aa16■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 DYRK4Q9NR20 520 aa16■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 LHX3Q9UBR4 397 aa16■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa16■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 SNX11Q9Y5W9 270 aa16■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 PLXNA2O75051 1894 aa15.99■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 ARHGAP42A6NI28 874 aa15.99■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 KRIT1O00522 736 aa15.99■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 OPHN1O60890 802 aa15.99■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 PROSCO94903 275 aa15.99■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 POP4O95707 220 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 CD48P09326 243 aa15.99■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 ARSEP51690 589 aa15.99■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 ZNF75DP51815 510 aa15.99■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 TAS2R40P59535 323 aa15.99■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 TEAD4Q15561 434 aa15.99■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 HLA-BQ31612 363 aa15.99■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa15.99■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 PIP4P1Q86T03 277 aa15.99■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 FAM71BQ8TC56 605 aa15.99■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 PPP1R16AQ96I34 528 aa15.99■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 GAREM1Q9H706 876 aa15.99■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 PREBQ9HCU5 417 aa15.99■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 DOCK9Q9BZ29 2069 aa15.99■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa15.99■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 A0A1W2PR77 199 aa15.98■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 UPK3BL1B0FP48 263 aa15.98■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 UPK3BL2E5RIL1 263 aa15.98■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 DFFAO00273 331 aa15.98■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 KCNK3O14649 394 aa15.98■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 INSIG1O15503 277 aa15.98■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 UGT2B4P06133 528 aa15.98■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 ADRB3P13945 408 aa15.98■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 KCNA4P22459 653 aa15.98■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 ARL4AP40617 200 aa15.98■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 NEK3P51956 506 aa15.98■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 RHOAP61586 193 aa15.98■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 FOXK2Q01167 660 aa15.98■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 MMRN1Q13201 1228 aa15.98■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 ZNF284Q2VY69 593 aa15.98■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa15.98■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 DEFB124Q8NES8 71 aa15.98■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 SLC35G2Q8TBE7 412 aa15.98■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 LRIG1Q96JA1 1093 aa15.98■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 SERAC1Q96JX3 654 aa15.98■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 EXOC2Q96KP1 924 aa15.98■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa15.98■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 FADS3Q9Y5Q0 445 aa15.98■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 PCNX2A6NKB5 2137 aa15.98■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 SPEGQ15772 3267 aa15.97■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 A0A1W2PQU0 124 aa15.97■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 C16orf96A6NNT2 1141 aa15.97■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 VILLO15195 856 aa15.97■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 SPINT1O43278 529 aa15.97■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 ABL2P42684 1182 aa15.97■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 CTSKP43235 329 aa15.97■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 SSR1P43307 286 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 RGRP47804 291 aa15.97■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 CDH6P55285 790 aa15.97■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 CCDC15Q0P6D6 951 aa15.97■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 ZNF805Q5CZA5 627 aa15.97■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 SEL1L3Q68CR1 1132 aa15.97■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 NEK5Q6P3R8 708 aa15.97■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 IL27RAQ6UWB1 636 aa15.97■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 HORMAD1Q86X24 394 aa15.97■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 LZTR1Q8N653 840 aa15.97■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 KLK6Q92876 244 aa15.97■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa15.97■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 KLHL32Q96NJ5 620 aa15.97■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa15.97■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 CA5BQ9Y2D0 317 aa15.97■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa15.96■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 MTA2O94776 668 aa15.96■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 PCDH8O95206 1070 aa15.96■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 CER1O95813 267 aa15.96■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 IGSF6O95976 241 aa15.96■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 PRLRP16471 622 aa15.96■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 CD38P28907 300 aa15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.4 ms