RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497842.6

TTC19-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, human

TSL 5

Gene TTC19, Length 1,360 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC19-208	ENST00000497842	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	28.93	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	SEMA3C	Q99985	751 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	28.93	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842		F5H423	210 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	MAN2B1	O00754	1011 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	MUSK	O15146	869 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	PSMD3	O43242	534 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	LMAN1	P49257	510 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	SEMA5A	Q13591	1074 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	GDF3	Q9NR23	364 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	ESYT3	A0FGR9	886 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	NPC1	O15118	1278 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	IGSF6	O95976	241 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	GEM	P55040	296 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	DSC2	Q02487	901 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	CUL1	Q13616	776 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	FAM3C	Q92520	227 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	EXOC2	Q96KP1	924 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	GSR	P00390	522 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	MCM3	P25205	808 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	CSNK1D	P48730	415 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	SCNN1B	P51168	640 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	TERF1	P54274	439 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	CAV1	Q03135	178 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	PRKCQ	Q04759	706 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF234	Q14588	700 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	IER5L	Q5T953	404 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	IFT81	Q8WYA0	676 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	KCNH6	Q9H252	994 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	EPC1	Q9H2F5	836 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	WNT16	Q9UBV4	365 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842		K7EQS6	105 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	SMAP	O00193	183 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	INSIG1	O15503	277 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	TUBB	P07437	444 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	APRT	P07741	180 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	SERPINF2	P08697	491 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	28.89	■■■□□ 2.22	2e-7	■■■■□ 20.1
TTC19-208	ENST00000497842	CR2	P20023	1033 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	MAPK8	P45983	427 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	RGR	P47804	291 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	ITGA8	P53708	1063 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	MORF4L2	Q15014	288 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	SRL	Q86TD4	932 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	HOOK3	Q86VS8	718 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	PLPP6	Q8IY26	295 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	CPT1B	Q92523	772 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	MYO19	Q96H55	970 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	28.89	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	VPS45	Q9NRW7	570 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TTC19-208	ENST00000497842	TTC34	A8MYJ7	566 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	CD86	P42081	329 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	MAGEA6	P43360	314 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	AP1S1	P61966	158 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	CDK16	Q00536	496 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	MPP3	Q13368	585 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	KCNJ11	Q14654	390 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	TRADD	Q15628	312 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	SLC14A2	Q15849	920 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
TTC19-208	ENST00000497842	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		28.88	■■■□□ 2.21

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