RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	NEMP2	A6NFY4	417 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC31A1	O15431	190 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV3-27	P01718	113 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	APOE	P02649	317 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	LTF	P02788	710 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	CKMT1A	P12532	417 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	DRD3	P35462	400 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	NFATC3	Q12968	1075 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	DCAF6	Q58WW2	860 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	CHSY1	Q86X52	802 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	APCDD1	Q8J025	514 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	LGI2	Q8N0V4	545 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	SEMA4D	Q92854	862 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	KLK6	Q92876	244 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPRN2	Q92932	1015 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	TP53INP1	Q96A56	240 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	AZIN2	Q96A70	460 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	PAGE5	Q96GU1	130 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	LMLN	Q96KR4	655 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM4	Q9C037	500 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	SATB2	Q9UPW6	733 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	VDR	P11473	427 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	MYF5	P13349	255 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	VAV1	P15498	845 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	PDGFRA	P16234	1089 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	PRLR	P16471	622 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	AKT2	P31751	481 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	CSRP3	P50461	194 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	METAP1	P53582	386 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	SULT2A1	Q06520	285 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	CNTN1	Q12860	1018 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	CUL2	Q13617	745 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	RESP18	Q5W5W9	173 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM69	Q86WT6	500 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF34	Q969K3	372 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	APOLD1	Q96LR9	279 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP41	Q9BYV8	373 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	MIS12	Q9H081	205 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	MGA	Q8IWI9	3026 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A096LPE4	126 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PPZ6	126 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PQU0	124 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	CPED1	A4D0V7	1026 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511		F5H5T6	163 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511		K7ENP7	123 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511		M0QYV0	167 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511		O00370	1275 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	PIAS2	O75928	621 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	GP1BA	P07359	652 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	ENPEP	Q07075	957 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	LRMP	Q12912	555 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC12A1	Q13621	1099 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	ISX	Q2M1V0	245 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZS46	218 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	ACAD11	Q709F0	780 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	SCML4	Q8N228	414 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	ARL14	Q8N4G2	192 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	IFI44	Q8TCB0	444 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	TCF12	Q99081	682 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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