RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 DGCR6Q14129 220 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRC-209ENST00000442510 PON3Q15166 354 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 FAM171A1Q5VUB5 890 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRC-209ENST00000442510 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
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PTPRC-209ENST00000442510 SEC14L1Q92503 715 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ELMO1Q92556 727 aa5.65□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 HIPK2Q9H2X6 1198 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ARMT1Q9H993 441 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 CLCA2Q9UQC9 943 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 TPRKBQ9Y3C4 175 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa5.65□□□□□ -1.51
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