RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 GSRP00390 522 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXA4-202ENST00000428284 KRT14P02533 472 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXA4-202ENST00000428284 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXA4-202ENST00000428284 NFKB1P19838 968 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXA4-202ENST00000428284 SCNN1BP51168 640 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXA4-202ENST00000428284 ENPP2Q13822 863 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXA4-202ENST00000428284 TRIM67Q6ZTA4 783 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXA4-202ENST00000428284 OR6K2Q8NGY2 324 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXA4-202ENST00000428284 SEMA3CQ99985 751 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXA4-202ENST00000428284 GLOD4Q9HC38 313 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXA4-202ENST00000428284 PCDH9Q9HC56 1237 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXA4-202ENST00000428284 SUN2Q9UH99 717 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXA4-202ENST00000428284 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
HOXA4-202ENST00000428284 TTI1O43156 1089 aa20.89■□□□□ 0.94
HOXA4-202ENST00000428284 CD68P34810 354 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
HOXA4-202ENST00000428284 VPS41P49754 854 aa20.89■□□□□ 0.94
HOXA4-202ENST00000428284 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
HOXA4-202ENST00000428284 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
HOXA4-202ENST00000428284 CARD16Q5EG05 197 aa20.89■□□□□ 0.94
HOXA4-202ENST00000428284 JAMLQ86YT9 394 aa20.89■□□□□ 0.94
HOXA4-202ENST00000428284 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
HOXA4-202ENST00000428284 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
HOXA4-202ENST00000428284 PTPRN2Q92932 1015 aa20.89■□□□□ 0.94
HOXA4-202ENST00000428284 ERLEC1Q96DZ1 483 aa20.89■□□□□ 0.94
HOXA4-202ENST00000428284 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa20.89■□□□□ 0.94
HOXA4-202ENST00000428284 GBA3Q9H227 469 aa20.89■□□□□ 0.94
HOXA4-202ENST00000428284 SCUBE2Q9NQ36 999 aa20.89■□□□□ 0.94
HOXA4-202ENST00000428284 PAK5Q9P286 719 aa20.89■□□□□ 0.94
HOXA4-202ENST00000428284 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 ADAM23O75077 832 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 SIN3BO75182 1162 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 GJB3O75712 270 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 HOXB2P14652 356 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 PTGIRP43119 386 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 DSC2Q02487 901 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP20.89■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 FZD5Q13467 585 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 STARD3Q14849 445 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 C8orf74Q6P047 294 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 MAATS1Q7Z4T9 603 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 OR2A12Q8NGT7 310 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 NUDCD1Q96RS6 583 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 GABRG3Q99928 467 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 OSBPL6Q9BZF3 934 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 SIT1Q9Y3P8 196 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 RAD51CO43502 376 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 CR2P20023 1033 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 PSMB4P28070 264 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 RPL22P35268 128 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 EOGTQ5NDL2 527 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 C9orf64Q5T6V5 341 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 ALG1LQ6GMV1 187 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 PKN3Q6P5Z2 889 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 SRLQ86TD4 932 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 MMGT1Q8N4V1 131 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 TRIM51Q9BSJ1 452 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 SLC25A51Q9H1U9 297 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 ASIC3Q9UHC3 531 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 INSIG1O15503 277 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 CD86P42081 329 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 AP1S1P61966 158 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 RAD51Q06609 339 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 NIPAL4Q0D2K0 466 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 GPS1Q13098 491 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 PTK6Q13882 451 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 FAXCQ5TGI0 409 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 PLPP6Q8IY26 295 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 STK40Q8N2I9 435 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 CHST14Q8NCH0 376 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 LRRN4CLQ8ND94 238 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 ARRDC2Q8TBH0 407 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 FCRL5Q96RD9 977 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 NOD2Q9HC29 1040 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 PRSS16Q9NQE7 514 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 MMP17Q9ULZ9 603 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 NEU2Q9Y3R4 380 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 METTL18O95568 372 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 CES1P23141 567 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 MAPK8P45983 427 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 CSNK1DP48730 415 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 PRPSAP1Q14558 356 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 MYLK3Q32MK0 819 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 RALGPS1Q5JS13 557 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 C4orf22Q6V702 233 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 CCHCR1Q8TD31 782 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 OR8D1Q8WZ84 308 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP20.86■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 FAM187AA6NFU0 413 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM221A6NGB7 291 aa20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms