RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 KDELC1Q6UW63 502 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 TPGS1Q6ZTW0 290 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF534Q76KX8 674 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM25Q86YD3 366 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 NPAS3Q8IXF0 933 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 LMNTD2Q8IXW0 634 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 YAF2Q8IY57 180 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 AHI1Q8N157 1196 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 NDUFAF2Q8N183 169 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 KDM1BQ8NB78 822 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 NETO2Q8NC67 525 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 GSDMBQ8TAX9 411 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ARRDC2Q8TBH0 407 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 NXPE3Q969Y0 559 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ELSPBP1Q96BH3 223 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 IFT43Q96FT9 208 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 SEMA3CQ99985 751 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 KIFC1Q9BW19 673 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 SCUBE2Q9NQ36 999 aa9.74□□□□□ -0.85
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HDLBP-211ENST00000425989 MOCS1Q9NZB8 636 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 VPS18Q9P253 973 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 SLC25A13Q9UJS0 675 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF180Q9UJW8 692 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 CCL26Q9Y258 94 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ACTL7BQ9Y614 415 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 TLDC2A0PJX2 215 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 HEATR9A2RTY3 570 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 AVILO75366 819 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ECI2O75521 394 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 NDST3O95803 873 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 GLP2RO95838 553 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 FGF1P05230 155 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 TYRP14679 529 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 PAMP19021 973 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 CR2P20023 1033 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 NFKBIAP25963 317 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 SSTR1P30872 391 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 CSKP41240 450 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 SERPINB9P50453 376 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 SGSHP51688 502 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 GPX6P59796 221 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ARF5P84085 180 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 SKOR1P84550 965 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 FCHO2Q0JRZ9 810 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 LMAN2Q12907 356 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 EML3Q32P44 896 aa9.73□□□□□ -0.85
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HDLBP-211ENST00000425989 LY6G5CQ5SRR4 150 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 CASC4Q6P4E1 433 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 PKN3Q6P5Z2 889 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 CHRDL2Q6WN34 429 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 MTSS1LQ765P7 747 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 SRLQ86TD4 932 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 LRRC6Q86X45 466 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 ANKMY2Q8IV38 441 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 OR52K1Q8NGK4 314 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 HCAR2Q8TDS4 363 aa9.73□□□□□ -0.85
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HDLBP-211ENST00000425989 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 MRGPRX2Q96LB1 330 aa9.73□□□□□ -0.85
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HDLBP-211ENST00000425989 SOX13Q9UN79 622 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 CHMP2BQ9UQN3 213 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 HS3ST2Q9Y278 367 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 TTLL3Q9Y4R7 772 aa9.73□□□□□ -0.85
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HDLBP-211ENST00000425989 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa9.72□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 HEPACAM2A8MVW5 462 aa9.72□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa9.72□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 PMPCBO75439 489 aa9.72□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 FAM155BO75949 473 aa9.72□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 PRAMEF12O95522 483 aa9.72□□□□□ -0.85
HDLBP-211ENST00000425989 POP4O95707 220 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
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