RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 CEP170P1Q96L14 293 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CNBD2Q96M20 576 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SPATA33Q96N06 139 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 APBA2Q99767 749 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PDZD7Q9H5P4 517 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TXNDC16Q9P2K2 825 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ADAM28Q9UKQ2 775 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SLC8A2Q9UPR5 921 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TMED5Q9Y3A6 229 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CEPT1Q9Y6K0 416 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 MEI4A8MW99 385 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 H7C0C1 242 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ITM2AO43736 263 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 GAS2O43903 313 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 BAIAP3O94812 1187 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ATP5OP48047 213 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ALDH3B2P48448 385 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 NUMBP49757 651 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PRKCEQ02156 737 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SP4Q02446 784 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGEF6Q15052 776 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 MAPRE2Q15555 327 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 UGCGQ16739 394 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 LY6KQ17RY6 165 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 DUSP28Q4G0W2 176 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 KCTD21Q4G0X4 260 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 KRT80Q6KB66 452 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TAPT1Q6NXT6 567 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC8BQ6P9F7 803 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 LPCAT2Q7L5N7 544 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TTC30AQ86WT1 665 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 HPS6Q86YV9 775 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 WDR49Q8IV35 697 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 UNC45BQ8IWX7 931 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 COLGALT2Q8IYK4 626 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PACRGLQ8N7B6 248 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 OR6P1Q8NGX9 317 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 COX4I2Q96KJ9 171 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TBCBQ99426 244 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 GPR20Q99678 358 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 EBF4Q9BQW3 602 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 MECRQ9BV79 373 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 EFCAB1Q9HAE3 211 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CYP4F11Q9HBI6 524 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 RIMS3Q9UJD0 308 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 A0A087WXM4 84 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 KANSL1LA0AUZ9 987 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PLIN3O60664 434 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 NOL3O60936 208 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ALDH1A2O94788 518 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 FBXO21O94952 628 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ASS1P00966 412 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 C1QAP02745 245 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 MCF2P10911 925 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 RALBP11234 206 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ATP6V1B1P15313 513 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 DNAJB1P25685 340 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SLC5A2P31639 672 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 HADHAP40939 763 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 MAGEA3P43357 314 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SNX16P57768 344 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 MYBPC1Q00872 1141 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 KLF10Q13118 480 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 BOLA3Q53S33 107 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 RALGPS1Q5JS13 557 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SLC39A4Q6P5W5 647 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 KLHL35Q6PF15 583 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TXNDC11Q6PKC3 985 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 RNF111Q6ZNA4 994 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 GPR141Q7Z602 305 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SYT9Q86SS6 491 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PDZD3Q86UT5 571 aa7.3□□□□□ -1.24
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