RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 MPIG6BO95866 241 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 OPN1LWP04000 364 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 HRGP04196 525 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 HMGN1P05114 100 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 GALTP07902 379 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PFKMP08237 780 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 KRT7P08729 469 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FGFR1P11362 822 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 KRT5P13647 590 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 IFNAR1P17181 557 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PDCP20941 246 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TNFSF4P23510 183 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 NFKBIAP25963 317 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ACSL1P33121 698 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 RFC2P35250 354 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 THPOP40225 353 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 NNMTP40261 264 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 IL15P40933 162 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 RGS2P41220 211 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TECP42680 631 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ME1P48163 572 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 NT5C2P49902 561 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 NEK4P51957 841 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ADARP55265 1226 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 RAB14P61106 215 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 GOLGA8FQ08AF8 430 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CHIT1Q13231 466 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SEMA5AQ13591 1074 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 RAPSNQ13702 412 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 RCN2Q14257 317 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 STARD3Q14849 445 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ZMYND11Q15326 602 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 RGS21Q2M5E4 152 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SMU1Q2TAY7 513 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 KCTD21Q4G0X4 260 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TTMPQ5BVD1 217 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FAM209AQ5JX71 171 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 HECTD2Q5U5R9 776 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 IQSEC1Q6DN90 963 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SIGIRRQ6IA17 410 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
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PTPRM-204ENST00000577468 KLHL24Q6TFL4 600 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF852Q6ZMS4 543 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 MACC1Q6ZN28 852 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 LRRC55Q6ZSA7 311 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRM-204ENST00000577468 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PHC2Q8IXK0 858 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 HACE1Q8IYU2 909 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SYCE1Q8N0S2 351 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 GALNT15Q8N3T1 639 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ANKFN1Q8N957 763 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ZBTB34Q8NCN2 500 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SIMC1Q8NDZ2 872 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 HIPK4Q8NE63 616 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TRPV1Q8NER1 839 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SPATA20Q8TB22 786 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TEX47Q8TBZ9 253 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 URGCPQ8TCY9 931 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 GANCQ8TET4 914 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ASZ1Q8WWH4 475 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ATL1Q8WXF7 558 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 RFFLQ8WZ73 363 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 HTRA1Q92743 480 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 HDAC10Q969S8 669 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ZUFSPQ96AP4 578 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PTERQ96BW5 349 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CHMP6Q96FZ7 201 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FAM20AQ96MK3 541 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF560Q96MR9 790 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PRAM1Q96QH2 718 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 C19orf43Q9BQ61 176 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC77Q9BR77 488 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SPATA9Q9BWV2 254 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 STK33Q9BYT3 514 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TTYH3Q9C0H2 523 aa3.14□□□□□ -1.91
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