RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548557.1

CASC18-202, Transcript of cancer susceptibility 18, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC18, Length 2,503 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC18-202ENST00000548557 STAP1Q9ULZ2 295 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 KRBA1A5PL33 1030 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 CFAP73A6NFT4 308 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 PER2O15055 1255 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 XYLBO75191 536 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 RNF8O76064 485 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 UBOX5O94941 541 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 TJP3O95049 919 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 EPN2O95208 641 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 FGF19O95750 216 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 KRT1P04264 644 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 SRGAP2BP0DMP2 458 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 GCAP28676 217 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 STX2P32856 288 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 PTPN7P35236 360 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 NRIP1P48552 1158 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 USP46P62068 366 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 OGDHQ02218 1023 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 TAF10Q12962 218 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 KCNC3Q14003 757 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 TAF5Q15542 800 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 OASLQ15646 514 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 SLC25A52Q3SY17 297 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 BTBD8Q5XKL5 378 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 GPR153Q6NV75 609 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 SPATA21Q7Z572 469 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 GALNT13Q8IUC8 556 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 DEFB106AQ8N104 65 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 TRIML2Q8N7C3 387 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 CCDC63Q8NA47 563 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 SPERTQ8NA61 448 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 STKLD1Q8NE28 680 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 IPMKQ8NFU5 416 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 GPR152Q8TDT2 470 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 RXFP2Q8WXD0 754 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 MAGEB18Q96M61 343 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 CFAP57Q96MR6 1250 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 ZNF148Q9UQR1 794 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 RFXAPO00287 272 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 NCAM2O15394 837 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 GRAP2O75791 330 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 ENDOD1O94919 500 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 F9P00740 461 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 FYNP06241 537 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 ETS1P14921 441 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 EPCAMP16422 314 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 TYRP1P17643 537 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 PSMA2P25787 234 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 PCK1P35558 622 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 MAPK8P45983 427 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 TUBP50607 506 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 ARSEP51690 589 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 SLC12A2P55011 1212 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 NCALDP61601 193 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 CCDC14Q49A88 953 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 DCAF6Q58WW2 860 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 WLSQ5T9L3 541 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 ZNF697Q5TEC3 545 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 CGB2Q6NT52 195 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 STRADAQ7RTN6 431 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 SCD5Q86SK9 330 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 TDRPQ86YL5 185 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 EMC1Q8N766 993 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 ACMSDQ8TDX5 336 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 TEKT4Q8WW24 435 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 TTC25Q96NG3 672 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 NPY6RQ99463 290 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 SARGQ9BW04 601 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 SAYSD1Q9NPB0 183 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 OBP2AQ9NY56 170 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC18-202ENST00000548557 GGT7Q9UJ14 662 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms