RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474820.5

RBMS1-209, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, human

TSL 1 (best)

Gene RBMS1, Length 4,016 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBMS1-209	ENST00000474820	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	SERPINB11	Q96P15	392 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820		A0A0U1RQF3	1178 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820		G3V2L1	256 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	TNFRSF10B	O14763	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	IFNB1	P01574	187 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	TH	P07101	528 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	CLTB	P09497	229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	RAP1GAP	P47736	663 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	SLC1A6	P48664	564 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	RAB15	P59190	212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	ERVK-21	P61565	698 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	PDE1B	Q01064	536 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	DSC1	Q08554	894 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	RCN2	Q14257	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	PARP15	Q460N3	678 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	ACAD11	Q709F0	780 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	DEFB106A	Q8N104	65 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	ROPN1L	Q96C74	230 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	MIPEP	Q99797	713 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	SYT15	Q9BQS2	421 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	MROH6	A6NGR9	719 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	HDAC3	O15379	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	KLK8	O60259	260 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	DDHD2	O94830	711 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	KLC1	Q07866	573 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	TUSC3	Q13454	348 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	LRRC14	Q15048	493 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	ACOT1	Q86TX2	421 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	TLK2	Q86UE8	772 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	EMC1	Q8N766	993 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	GDAP1	Q8TB36	358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	ZNF576	Q9H609	170 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	GMEB1	Q9Y692	573 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-209	ENST00000474820	LAMA3	Q16787	3333 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.9 ms