RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447117.1

PTENP1-201, Transcript of phosphatase and tensin homolog pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PTENP1, Length 1,215 nt, Biotype transcribed processed pseudogene, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP1-201ENST00000447117 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTENP1-201ENST00000447117 MAPK7Q13164 816 aa4.72□□□□□ -1.65
PTENP1-201ENST00000447117 SLC18A3Q16572 532 aa4.72□□□□□ -1.65
PTENP1-201ENST00000447117 ODF3L2Q3SX64 289 aa4.72□□□□□ -1.65
PTENP1-201ENST00000447117 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTENP1-201ENST00000447117 DCAF12L2Q5VW00 463 aa4.72□□□□□ -1.65
PTENP1-201ENST00000447117 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa4.72□□□□□ -1.65
PTENP1-201ENST00000447117 RETSATQ6NUM9 610 aa4.72□□□□□ -1.65
PTENP1-201ENST00000447117 TMEM71Q6P5X7 295 aa4.72□□□□□ -1.65
PTENP1-201ENST00000447117 LRRC8DQ7L1W4 858 aa4.72□□□□□ -1.65
PTENP1-201ENST00000447117 HORMAD2Q8N7B1 307 aa4.72□□□□□ -1.65
PTENP1-201ENST00000447117 TEX45Q8NA69 505 aa4.72□□□□□ -1.65
PTENP1-201ENST00000447117 RFWD2Q8NHY2 731 aa4.72□□□□□ -1.65
PTENP1-201ENST00000447117 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTENP1-201ENST00000447117 HSPH1Q92598 858 aa4.72□□□□□ -1.65
PTENP1-201ENST00000447117 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTENP1-201ENST00000447117 HIF1ANQ9NWT6 349 aa4.72□□□□□ -1.65
PTENP1-201ENST00000447117 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa4.72□□□□□ -1.65
PTENP1-201ENST00000447117 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTENP1-201ENST00000447117 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa4.71□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa4.71□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 MS4A18H0YCH9 400 aa4.71□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 NCAM2O15394 837 aa4.71□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 SPRY3O43610 288 aa4.71□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 GNLYP22749 145 aa4.71□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 PTPN9P43378 593 aa4.71□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 CENPAP49450 140 aa4.71□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 BLKP51451 505 aa4.71□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 CDH12P55289 794 aa4.71□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 GPR18Q14330 331 aa4.71□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 PDXDC1Q6P996 788 aa4.71□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 ZNF549Q6P9A3 640 aa4.71□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 IL20RBQ6UXL0 311 aa4.71□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 GLCCI1Q86VQ1 547 aa4.71□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 RBFAQ8N0V3 343 aa4.71□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 CADM3Q8N126 398 aa4.71□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 DNAAF1Q8NEP3 725 aa4.71□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 TNIP2Q8NFZ5 429 aa4.71□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 CEP76Q8TAP6 659 aa4.71□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 STAMQ92783 540 aa4.71□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 CLSTN3Q9BQT9 956 aa4.71□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 WACQ9BTA9 647 aa4.71□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 CXorf56Q9H5V9 222 aa4.71□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 RRN3Q9NYV6 651 aa4.71□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 NLKQ9UBE8 527 aa4.71□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 EYA2O00167 538 aa4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 PER2O15055 1255 aa4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 SNHG28P0DPA3 235 aa4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 PGM1P36871 562 aa4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 PPP3CCP48454 512 aa4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 ARSFP54793 590 aa4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 TRPC3Q13507 836 aa4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 ME3Q16798 604 aa4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 Q6ZTK2 550 aa4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 PRSS45Q7RTY3 260 aa4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 CPXM2Q8N436 756 aa4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 MCPH1Q8NEM0 835 aa4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 LYZL4Q96KX0 146 aa4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 GPR63Q9BZJ6 419 aa4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 LMAN2LQ9H0V9 348 aa4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 MROH8Q9H579 483 aa4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 EPHX3Q9H6B9 360 aa4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 SAGE1Q9NXZ1 904 aa4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 IL36RNQ9UBH0 155 aa4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 PGAP2Q9UHJ9 254 aa4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 SLC13A4Q9UKG4 626 aa4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 GAGE10A6NGK3 116 aa4.69□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 OR6C75A6NL08 312 aa4.69□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 VWA5AO00534 786 aa4.69□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 CLDN7O95471 211 aa4.69□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 LCATP04180 440 aa4.69□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 ARRB2P32121 409 aa4.69□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 MAPK9P45984 424 aa4.69□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 SLC18A2Q05940 514 aa4.69□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 FHL1Q13642 323 aa4.69□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 NAA25Q14CX7 972 aa4.69□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 DCAF6Q58WW2 860 aa4.69□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa4.69□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 MARK4Q96L34 752 aa4.69□□□□□ -1.66
PTENP1-201ENST00000447117 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms