RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 ECEL1O95672 775 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 NTSR1P30989 418 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 ENPP2Q13822 863 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 P3H1Q32P28 736 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF567Q8N184 647 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 FRS2Q8WU20 508 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 SPATA13Q96N96 652 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 AGAP3Q96P47 875 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 KRT12Q99456 494 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 MGME1Q9BQP7 344 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 MFSD1Q9H3U5 465 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 LMAN1LQ9HAT1 526 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 SUN2Q9UH99 717 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 TTLL3Q9Y4R7 772 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 STON1Q9Y6Q2 735 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 TTC34A8MYJ7 566 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 OPHN1O60890 802 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 GCATO75600 419 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 HLA-DQB2P05538 268 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 PID1Q7Z2X4 250 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 IL17RCQ8NAC3 791 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 SLCO2A1Q92959 643 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 ACOX2Q99424 681 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 LHX3Q9UBR4 397 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 VCANP13611 3396 aa28.21■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa28.21■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 ANTXRLA6NF34 631 aa28.21■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP28.21■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa28.21■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM67Q6ZTA4 783 aa28.21■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 CNTD1Q8N815 330 aa28.21■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 PJA1Q8NG27 643 aa28.21■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 CARD6Q9BX69 1037 aa28.21■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 TM6SF2Q9BZW4 377 aa28.21■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa28.21■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 IGSF6O95976 241 aa28.2■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 GSRP00390 522 aa28.2■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 ITKQ08881 620 aa28.2■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 PLPP6Q8IY26 295 aa28.2■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 OR2AP1Q8NGE2 309 aa28.2■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa28.2■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa28.2■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 TNKS2Q9H2K2 1166 aa28.2■■■□□ 2.11
GIPC1-201ENST00000345425 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 EPHX1P07099 455 aa28.19■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 PRKCHP24723 683 aa28.19■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 NRLP54845 237 aa28.19■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 DR1Q01658 176 aa28.19■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa28.19■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 Q6ZVU0 165 aa28.19■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 PGBD5Q8N414 524 aa28.19■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC110Q8TBZ0 833 aa28.19■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 GABRG3Q99928 467 aa28.19■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 TRIOO75962 3097 aa28.19■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 WASH3PC4AMC7 463 aa28.19■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 MUSKO15146 869 aa28.19■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 HLA-EP13747 358 aa28.19■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 CES1P23141 567 aa28.19■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 MAXP61244 160 aa28.19■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 CARD16Q5EG05 197 aa28.19■■■□□ 2.1
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GIPC1-201ENST00000345425 C4orf22Q6V702 233 aa28.19■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 MAATS1Q7Z4T9 603 aa28.19■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF366Q8N895 744 aa28.19■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 PTPRN2Q92932 1015 aa28.19■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 EXOC2Q96KP1 924 aa28.19■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 PCDH9Q9HC56 1237 aa28.19■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 PAK5Q9P286 719 aa28.19■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 ATG2BQ96BY7 2078 aa28.18■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 CSNK1DP48730 415 aa28.18■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 PPP1R7Q15435 360 aa28.18■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 RALGPS1Q5JS13 557 aa28.18■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 EOGTQ5NDL2 527 aa28.18■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 GLOD4Q9HC38 313 aa28.18■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 SIT1Q9Y3P8 196 aa28.18■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 BNIP3LO60238 219 aa28.17■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 WASP42768 502 aa28.17■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 MAPK8P45983 427 aa28.17■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 FZD5Q13467 585 aa28.17■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 STARD3Q14849 445 aa28.17■■■□□ 2.1
GIPC1-201ENST00000345425 FLCNQ8NFG4 579 aa28.17■■■□□ 2.1
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