RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321358.11

YBX1-201, Transcript of Y-box binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene YBX1, Length 1,514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1-201ENST00000321358 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 GAS8O95995 478 aa21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 IL12RB1P42701 662 aa21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 EOGTQ5NDL2 527 aa21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 ALLCQ8N6M5 410 aa21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 IL12RB2Q99665 862 aa21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 TMEM245Q9H330 911 aa21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 COL4A2P08572 1712 aa21.49■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 CTAGE15A4D2H0 777 aa21.49■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 IGSF6O95976 241 aa21.49■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 CTAGE8P0CG41 777 aa21.49■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 CES1P23141 567 aa21.49■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 PTPN3P26045 913 aa21.49■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 RAD51Q06609 339 aa21.49■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 WASHC5Q12768 1159 aa21.49■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 ZBTB17Q13105 803 aa21.49■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa21.49■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 CTAGE6Q86UF2 777 aa21.49■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 CTAGE4Q8IX94 777 aa21.49■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 IL17RCQ8NAC3 791 aa21.49■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa21.49■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 ACOX2Q99424 681 aa21.49■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 CEP41Q9BYV8 373 aa21.49■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 TM6SF2Q9BZW4 377 aa21.49■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 TNKS2Q9H2K2 1166 aa21.49■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa21.49■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 C5orf60A6NFR6 353 aa21.48■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 WASH3PC4AMC7 463 aa21.48■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 OPHN1O60890 802 aa21.48■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 ECEL1O95672 775 aa21.48■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 WASP42768 502 aa21.48■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 CARD16Q5EG05 197 aa21.48■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa21.48■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 Q6ZVU0 165 aa21.48■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 PLPP6Q8IY26 295 aa21.48■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 ZNF687Q8N1G0 1237 aa21.48■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 OR2AP1Q8NGE2 309 aa21.48■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 FRS2Q8WU20 508 aa21.48■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 MYO19Q96H55 970 aa21.48■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 TEKT5Q96M29 485 aa21.48■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 HCN2Q9UL51 889 aa21.48■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 NUP205Q92621 2012 aa21.48■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 TMEM221A6NGB7 291 aa21.47■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 M0R296 226 aa21.47■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 GCATO75600 419 aa21.47■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 GSRP00390 522 aa21.47■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 HLA-EP13747 358 aa21.47■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 MAPK8P45983 427 aa21.47■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 SCNN1BP51168 640 aa21.47■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 ENPP2Q13822 863 aa21.47■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 P3H1Q32P28 736 aa21.47■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa21.47■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa21.47■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa21.47■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 TTC27Q6P3X3 843 aa21.47■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 ZNF567Q8N184 647 aa21.47■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 ZNF366Q8N895 744 aa21.47■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 RTP4Q96DX8 246 aa21.47■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 SPATA13Q96N96 652 aa21.47■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 KRT12Q99456 494 aa21.47■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 MGME1Q9BQP7 344 aa21.47■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 PCYOX1Q9UHG3 505 aa21.47■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 HLA-DQB2P05538 268 aa21.46■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 HOXB2P14652 356 aa21.46■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 PRKCHP24723 683 aa21.46■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 MAGEA9P43362 315 aa21.46■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 RPS9P46781 194 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 PPP1R7Q15435 360 aa21.46■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 C4orf22Q6V702 233 aa21.46■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 MAATS1Q7Z4T9 603 aa21.46■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 DSG4Q86SJ6 1040 aa21.46■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 CCDC110Q8TBZ0 833 aa21.46■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 CLDN23Q96B33 292 aa21.46■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 EXOC2Q96KP1 924 aa21.46■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa21.46■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 GABRG3Q99928 467 aa21.46■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 SCUBE2Q9NQ36 999 aa21.46■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 LHX3Q9UBR4 397 aa21.46■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 MMP17Q9ULZ9 603 aa21.46■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa21.46■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 ANTXRLA6NF34 631 aa21.45■■□□□ 1.02
YBX1-201ENST00000321358 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa21.45■■□□□ 1.02
YBX1-201ENST00000321358 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
YBX1-201ENST00000321358 POP4O95707 220 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
YBX1-201ENST00000321358 CSNK1DP48730 415 aa21.45■■□□□ 1.02
YBX1-201ENST00000321358 GDF10P55107 478 aa21.45■■□□□ 1.02
YBX1-201ENST00000321358 MAXP61244 160 aa21.45■■□□□ 1.02
YBX1-201ENST00000321358 DR1Q01658 176 aa21.45■■□□□ 1.02
YBX1-201ENST00000321358 C2orf54Q08AI8 447 aa21.45■■□□□ 1.02
YBX1-201ENST00000321358 PRPSAP1Q14558 356 aa21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms