RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GLOD4Q9HC38 313 aa16.79■□□□□ 0.28
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IRF9Q00978 393 aa16.76■□□□□ 0.27
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CLLU1OSQ5K130 101 aa16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRAF7Q6Q0C0 670 aa16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MAVSQ7Z434 540 aa16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SCN4BQ8IWT1 228 aa16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NUP93Q8N1F7 819 aa16.76■□□□□ 0.27
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