RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa20.56■□□□□ 0.88
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RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
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RABGGTA-210ENST00000559586 TM7SF3Q9NS93 570 aa20.54■□□□□ 0.88
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RABGGTA-210ENST00000559586 HLA-BQ31612 363 aa20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-210ENST00000559586 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-210ENST00000559586 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-210ENST00000559586 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-210ENST00000559586 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
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RABGGTA-210ENST00000559586 VASPP50552 380 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
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RABGGTA-210ENST00000559586 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
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RABGGTA-210ENST00000559586 SPTLC3Q9NUV7 552 aa20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-210ENST00000559586 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-210ENST00000559586 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-210ENST00000559586 NUMA1Q14980 2115 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-210ENST00000559586 ILVBLA1L0T0 632 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-210ENST00000559586 TTC34A8MYJ7 566 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-210ENST00000559586 DNTTP04053 509 aa20.5■□□□□ 0.87
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